RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374970.6

CERKL-204, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERKL, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-204ENST00000374970 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.79■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 ZMYM3Q14202 1370 aa32.78■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.78■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 NCOA1Q15788 1441 aa32.77■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 ERBINQ96RT1 1412 aa32.77■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.77■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.77■■■□□ 2.84
CERKL-204ENST00000374970 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.75■■■□□ 2.83
CERKL-204ENST00000374970 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.74■■■□□ 2.83
CERKL-204ENST00000374970 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.72■■■□□ 2.83
CERKL-204ENST00000374970 PTPRKQ15262 1439 aa32.71■■■□□ 2.83
CERKL-204ENST00000374970 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
CERKL-204ENST00000374970 NPATQ14207 1427 aa32.71■■■□□ 2.83
CERKL-204ENST00000374970 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.67■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.65■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 ABCC3O15438 1527 aa32.64■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 DEPDC5O75140 1603 aa32.64■■■□□ 2.82
CERKL-204ENST00000374970 ROCK1Q13464 1354 aa32.62■■■□□ 2.81
CERKL-204ENST00000374970 PZPP20742 1482 aa32.61■■■□□ 2.81
CERKL-204ENST00000374970 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.58■■■□□ 2.81
CERKL-204ENST00000374970 HSPA2P54652 639 aa32.57■■■□□ 2.8
CERKL-204ENST00000374970 CEP152O94986 1710 aa32.56■■■□□ 2.8
CERKL-204ENST00000374970 ITGAEP38570 1179 aa32.55■■■□□ 2.8
CERKL-204ENST00000374970 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.54■■■□□ 2.8
CERKL-204ENST00000374970 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.52■■■□□ 2.8
CERKL-204ENST00000374970 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.5■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 KANK1Q14678 1352 aa32.49■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.48■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.46■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 TNRQ92752 1358 aa32.46■■■□□ 2.79
CERKL-204ENST00000374970 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
CERKL-204ENST00000374970 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.44■■■□□ 2.78
CERKL-204ENST00000374970 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.44■■■□□ 2.78
CERKL-204ENST00000374970 UNC13BO14795 1591 aa32.42■■■□□ 2.78
CERKL-204ENST00000374970 ERVK-7P63135 1459 aa32.41■■■□□ 2.78
CERKL-204ENST00000374970 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.39■■■□□ 2.78
CERKL-204ENST00000374970 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.36■■■□□ 2.77
CERKL-204ENST00000374970 NLRP1Q9C000 1473 aa32.36■■■□□ 2.77
CERKL-204ENST00000374970 STRCQ7RTU9 1775 aa32.35■■■□□ 2.77
CERKL-204ENST00000374970 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.32■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 NAIPQ13075 1403 aa32.32■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 PLA2R1Q13018 1463 aa32.29■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 TET3O43151 1660 aa32.29■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.28■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 HFM1A2PYH4 1435 aa32.27■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CERKL-204ENST00000374970 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CERKL-204ENST00000374970 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.24■■■□□ 2.75
CERKL-204ENST00000374970 NUP155O75694 1391 aa32.22■■■□□ 2.75
CERKL-204ENST00000374970 NOS1P29475 1434 aa32.22■■■□□ 2.75
CERKL-204ENST00000374970 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.21■■■□□ 2.75
CERKL-204ENST00000374970 PTPRTO14522 1441 aa32.19■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 SYNMO15061 1565 aa32.19■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 E9PCH4 1651 aa32.16■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 PKD2Q13563 968 aa32.16■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 UBR1Q8IWV7 1749 aa32.15■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.14■■■□□ 2.74
CERKL-204ENST00000374970 PIK3C2BO00750 1634 aa32.12■■■□□ 2.73
CERKL-204ENST00000374970 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CERKL-204ENST00000374970 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
CERKL-204ENST00000374970 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.07■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 IDI1Q13907 227 aa32.07■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.06■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.04■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 ADGRB3O60242 1522 aa32.03■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 SLIT1O75093 1534 aa32.03■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.01■■■□□ 2.72
CERKL-204ENST00000374970 MED14O60244 1454 aa32■■■□□ 2.71
CERKL-204ENST00000374970 TRIM52Q96A61 297 aa31.97■■■□□ 2.71
CERKL-204ENST00000374970 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.97■■■□□ 2.71
CERKL-204ENST00000374970 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.95■■■□□ 2.71
CERKL-204ENST00000374970 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.95■■■□□ 2.71
CERKL-204ENST00000374970 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
CERKL-204ENST00000374970 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CERKL-204ENST00000374970 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.93■■■□□ 2.7
CERKL-204ENST00000374970 IQGAP1P46940 1657 aa31.92■■■□□ 2.7
CERKL-204ENST00000374970 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.92■■■□□ 2.7
CERKL-204ENST00000374970 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.9■■■□□ 2.7
CERKL-204ENST00000374970 LTKP29376 864 aa31.89■■■□□ 2.7
CERKL-204ENST00000374970 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 TRPM2O94759 1503 aa31.87■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.87■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.87■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 EID1Q9Y6B2 187 aa31.86■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 CERKQ8TCT0 537 aa31.84■■■□□ 2.69
CERKL-204ENST00000374970 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.82■■■□□ 2.68
CERKL-204ENST00000374970 ZFYVE9O95405 1425 aa31.82■■■□□ 2.68
CERKL-204ENST00000374970 CLTCL1P53675 1640 aa31.79■■■□□ 2.68
CERKL-204ENST00000374970 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CERKL-204ENST00000374970 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.77■■■□□ 2.68
CERKL-204ENST00000374970 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.76■■■□□ 2.67
CERKL-204ENST00000374970 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms