RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369642.7

RHOC-208, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOC, Length 1,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOC-208ENST00000369642 MROH2AA6NES4 1674 aa41.58■■■■■ 4.25
RHOC-208ENST00000369642 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.58■■■■■ 4.25
RHOC-208ENST00000369642 C3P01024 1663 aa41.56■■■■■ 4.24
RHOC-208ENST00000369642 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
RHOC-208ENST00000369642 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.55■■■■■ 4.24
RHOC-208ENST00000369642 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.54■■■■■ 4.24
RHOC-208ENST00000369642 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
RHOC-208ENST00000369642 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.52■■■■■ 4.24
RHOC-208ENST00000369642 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.5■■■■■ 4.23
RHOC-208ENST00000369642 ROCK1Q13464 1354 aa41.5■■■■■ 4.23
RHOC-208ENST00000369642 ZMYM3Q14202 1370 aa41.48■■■■■ 4.23
RHOC-208ENST00000369642 ITGAEP38570 1179 aa41.44■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 DEPDC5O75140 1603 aa41.43■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.4■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.39■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 ABCC3O15438 1527 aa41.39■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.38■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
RHOC-208ENST00000369642 NPATQ14207 1427 aa41.35■■■■■ 4.21
RHOC-208ENST00000369642 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.33■■■■■ 4.21
RHOC-208ENST00000369642 PZPP20742 1482 aa41.29■■■■■ 4.2
RHOC-208ENST00000369642 CEP152O94986 1710 aa41.28■■■■■ 4.2
RHOC-208ENST00000369642 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.27■■■■■ 4.2
RHOC-208ENST00000369642 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
RHOC-208ENST00000369642 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.23■■■■■ 4.19
RHOC-208ENST00000369642 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.23■■■■■ 4.19
RHOC-208ENST00000369642 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.194e-7■□□□□ 9.5
RHOC-208ENST00000369642 KANK1Q14678 1352 aa41.2■■■■■ 4.19
RHOC-208ENST00000369642 UNC13BO14795 1591 aa41.2■■■■■ 4.19
RHOC-208ENST00000369642 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.19■■■■■ 4.18
RHOC-208ENST00000369642 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
RHOC-208ENST00000369642 NAIPQ13075 1403 aa41.14■■■■■ 4.18
RHOC-208ENST00000369642 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
RHOC-208ENST00000369642 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.14■■■■■ 4.18
RHOC-208ENST00000369642 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.13■■■■■ 4.18
RHOC-208ENST00000369642 HFM1A2PYH4 1435 aa41.11■■■■■ 4.17
RHOC-208ENST00000369642 HSPA2P54652 639 aa41.11■■■■■ 4.17
RHOC-208ENST00000369642 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.09■■■■■ 4.17
RHOC-208ENST00000369642 TNRQ92752 1358 aa41.08■■■■■ 4.17
RHOC-208ENST00000369642 ERVK-7P63135 1459 aa41.08■■■■■ 4.17
RHOC-208ENST00000369642 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
RHOC-208ENST00000369642 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.06■■■■■ 4.16
RHOC-208ENST00000369642 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
RHOC-208ENST00000369642 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.01■■■■■ 4.16
RHOC-208ENST00000369642 TET3O43151 1660 aa40.99■■■■■ 4.15
RHOC-208ENST00000369642 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.97■■■■■ 4.15
RHOC-208ENST00000369642 NLRP1Q9C000 1473 aa40.95■■■■■ 4.15
RHOC-208ENST00000369642 NUP155O75694 1391 aa40.95■■■■■ 4.15
RHOC-208ENST00000369642 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
RHOC-208ENST00000369642 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
RHOC-208ENST00000369642 NOS1P29475 1434 aa40.87■■■■■ 4.13
RHOC-208ENST00000369642 STRCQ7RTU9 1775 aa40.84■■■■■ 4.13
RHOC-208ENST00000369642 SYNMO15061 1565 aa40.84■■■■■ 4.13
RHOC-208ENST00000369642 E9PCH4 1651 aa40.83■■■■■ 4.13
RHOC-208ENST00000369642 PLA2R1Q13018 1463 aa40.81■■■■■ 4.12
RHOC-208ENST00000369642 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.8■■■■■ 4.12
RHOC-208ENST00000369642 PIK3C2BO00750 1634 aa40.71■■■■■ 4.11
RHOC-208ENST00000369642 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.7■■■■■ 4.11
RHOC-208ENST00000369642 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.7■■■■■ 4.11
RHOC-208ENST00000369642 TRIM52Q96A61 297 aa40.67■■■■■ 4.1
RHOC-208ENST00000369642 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
RHOC-208ENST00000369642 IDI1Q13907 227 aa40.65■■■■■ 4.1
RHOC-208ENST00000369642 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.63■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.62■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 PTPRTO14522 1441 aa40.62■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 PKD2Q13563 968 aa40.61■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.6■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.59■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 ADGRB3O60242 1522 aa40.59■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.57■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.57■■■■■ 4.09
RHOC-208ENST00000369642 SLIT1O75093 1534 aa40.55■■■■■ 4.08
RHOC-208ENST00000369642 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.55■■■■■ 4.08
RHOC-208ENST00000369642 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
RHOC-208ENST00000369642 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
RHOC-208ENST00000369642 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.49■■■■■ 4.07
RHOC-208ENST00000369642 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.49■■■■■ 4.07
RHOC-208ENST00000369642 TRPM2O94759 1503 aa40.49■■■■■ 4.07
RHOC-208ENST00000369642 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.48■■■■■ 4.07
RHOC-208ENST00000369642 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.47■■■■■ 4.07
RHOC-208ENST00000369642 MED14O60244 1454 aa40.47■■■■■ 4.07
RHOC-208ENST00000369642 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
RHOC-208ENST00000369642 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.42■■■■■ 4.06
RHOC-208ENST00000369642 CLTCL1P53675 1640 aa40.4■■■■■ 4.06
RHOC-208ENST00000369642 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.4■■■■■ 4.06
RHOC-208ENST00000369642 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
RHOC-208ENST00000369642 LTKP29376 864 aa40.38■■■■■ 4.06
RHOC-208ENST00000369642 HRCP23327 699 aa40.36■■■■■ 4.05
RHOC-208ENST00000369642 IQGAP1P46940 1657 aa40.36■■■■■ 4.05
RHOC-208ENST00000369642 FOXD1Q16676 465 aa40.35■■■■■ 4.05
RHOC-208ENST00000369642 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.35■■■■■ 4.05
RHOC-208ENST00000369642 ZFYVE9O95405 1425 aa40.34■■■■■ 4.05
RHOC-208ENST00000369642 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
RHOC-208ENST00000369642 EID1Q9Y6B2 187 aa40.32■■■■■ 4.04
RHOC-208ENST00000369642 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.28■■■■■ 4.04
RHOC-208ENST00000369642 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.26■■■■■ 4.03
RHOC-208ENST00000369642 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms