RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368780.3

LCE2B-201, Transcript of late cornified envelope 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCE2B, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE2B-201ENST00000368780 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.94■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.93■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.93■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 NPATQ14207 1427 aa29.92■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.91■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.9■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
LCE2B-201ENST00000368780 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.89■■■□□ 2.37
LCE2B-201ENST00000368780 PTPRKQ15262 1439 aa29.88■■■□□ 2.37
LCE2B-201ENST00000368780 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
LCE2B-201ENST00000368780 ERBINQ96RT1 1412 aa29.86■■■□□ 2.37
LCE2B-201ENST00000368780 NCOA1Q15788 1441 aa29.81■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.81■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 ABCC3O15438 1527 aa29.8■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 ADGRL2O95490 1459 aa29.8■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 PZPP20742 1482 aa29.8■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.79■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
LCE2B-201ENST00000368780 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 TNRQ92752 1358 aa29.73■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 ITGAEP38570 1179 aa29.72■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 CEP152O94986 1710 aa29.71■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
LCE2B-201ENST00000368780 DEPDC5O75140 1603 aa29.7■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 KANK1Q14678 1352 aa29.68■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.68■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.67■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 STRCQ7RTU9 1775 aa29.67■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.65■■■□□ 2.34
LCE2B-201ENST00000368780 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.63■■■□□ 2.33
LCE2B-201ENST00000368780 ROCK1Q13464 1354 aa29.63■■■□□ 2.33
LCE2B-201ENST00000368780 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
LCE2B-201ENST00000368780 ERVK-7P63135 1459 aa29.61■■■□□ 2.33
LCE2B-201ENST00000368780 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.6■■■□□ 2.33
LCE2B-201ENST00000368780 NLRP1Q9C000 1473 aa29.59■■■□□ 2.33
LCE2B-201ENST00000368780 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.57■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.57■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 PLA2R1Q13018 1463 aa29.56■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.55■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.55■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 PTPRTO14522 1441 aa29.54■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.52■■■□□ 2.32
LCE2B-201ENST00000368780 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.5■■■□□ 2.31
LCE2B-201ENST00000368780 PKD2Q13563 968 aa29.49■■■□□ 2.31
LCE2B-201ENST00000368780 UNC13BO14795 1591 aa29.48■■■□□ 2.31
LCE2B-201ENST00000368780 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
LCE2B-201ENST00000368780 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
LCE2B-201ENST00000368780 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
LCE2B-201ENST00000368780 TET3O43151 1660 aa29.4■■■□□ 2.3
LCE2B-201ENST00000368780 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.38■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 NUP155O75694 1391 aa29.38■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 CERKQ8TCT0 537 aa29.37■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 SYNMO15061 1565 aa29.36■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.36■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.36■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 NOS1P29475 1434 aa29.36■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.35■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.34■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 NAIPQ13075 1403 aa29.34■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 PIK3C2BO00750 1634 aa29.34■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.33■■■□□ 2.29
LCE2B-201ENST00000368780 FBXO41Q8TF61 875 aa29.32■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 IDI1Q13907 227 aa29.31■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 HFM1A2PYH4 1435 aa29.29■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.28■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 E9PCH4 1651 aa29.28■■■□□ 2.28
LCE2B-201ENST00000368780 MED14O60244 1454 aa29.26■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.26■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 SLIT1O75093 1534 aa29.25■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 ADGRB3O60242 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.23■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 IQGAP1P46940 1657 aa29.22■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.22■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.21■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 EID1Q9Y6B2 187 aa29.21■■■□□ 2.27
LCE2B-201ENST00000368780 LTKP29376 864 aa29.19■■■□□ 2.26
LCE2B-201ENST00000368780 TRIM52Q96A61 297 aa29.17■■■□□ 2.26
LCE2B-201ENST00000368780 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
LCE2B-201ENST00000368780 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
LCE2B-201ENST00000368780 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.1■■■□□ 2.25
LCE2B-201ENST00000368780 CPS1P31327 1500 aa29.08■■■□□ 2.25
LCE2B-201ENST00000368780 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.08■■■□□ 2.25
LCE2B-201ENST00000368780 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.06■■■□□ 2.24
LCE2B-201ENST00000368780 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.04■■■□□ 2.24
LCE2B-201ENST00000368780 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
LCE2B-201ENST00000368780 ZFYVE9O95405 1425 aa29.03■■■□□ 2.24
LCE2B-201ENST00000368780 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LCE2B-201ENST00000368780 BCANQ96GW7 911 aa29.02■■■□□ 2.24
LCE2B-201ENST00000368780 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms