RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368780.3

LCE2B-201, Transcript of late cornified envelope 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCE2B, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE2B-201ENST00000368780 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.45■■■■■ 5.19
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LCE2B-201ENST00000368780 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.95■■■■□ 3.83
LCE2B-201ENST00000368780 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.89■■■■□ 3.82
LCE2B-201ENST00000368780 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.7■■■■□ 3.79
LCE2B-201ENST00000368780 SCRIBQ14160 1630 aa38.63■■■■□ 3.77
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LCE2B-201ENST00000368780 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.26■■■■□ 3.72
LCE2B-201ENST00000368780 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
LCE2B-201ENST00000368780 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.61■■■■□ 3.61
LCE2B-201ENST00000368780 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.43■■■■□ 3.58
LCE2B-201ENST00000368780 SMARCA4P51532 1647 aa36.88■■■■□ 3.49
LCE2B-201ENST00000368780 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
LCE2B-201ENST00000368780 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.72■■■■□ 3.47
LCE2B-201ENST00000368780 NCAPD3P42695 1498 aa36.71■■■■□ 3.47
LCE2B-201ENST00000368780 SMARCA2P51531 1590 aa36.67■■■■□ 3.46
LCE2B-201ENST00000368780 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.58■■■■□ 3.45
LCE2B-201ENST00000368780 HMGXB3Q12766 1538 aa36.54■■■■□ 3.44
LCE2B-201ENST00000368780 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.48■■■■□ 3.43
LCE2B-201ENST00000368780 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
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LCE2B-201ENST00000368780 ERCC6Q03468 1493 aa35.94■■■■□ 3.34
LCE2B-201ENST00000368780 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.8■■■■□ 3.32
LCE2B-201ENST00000368780 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
LCE2B-201ENST00000368780 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.65■■■■□ 3.3
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LCE2B-201ENST00000368780 CUX2O14529 1486 aa35.56■■■■□ 3.28
LCE2B-201ENST00000368780 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.5■■■■□ 3.27
LCE2B-201ENST00000368780 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
LCE2B-201ENST00000368780 CFTRP13569 1480 aa35.39■■■■□ 3.26
LCE2B-201ENST00000368780 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.35■■■■□ 3.25
LCE2B-201ENST00000368780 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.28■■■■□ 3.24
LCE2B-201ENST00000368780 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.26■■■■□ 3.23
LCE2B-201ENST00000368780 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.25■■■■□ 3.23
LCE2B-201ENST00000368780 WDR62O43379 1518 aa35.12■■■■□ 3.21
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LCE2B-201ENST00000368780 PRDM2Q13029 1718 aa35.06■■■■□ 3.2
LCE2B-201ENST00000368780 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
LCE2B-201ENST00000368780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.72■■■■□ 3.15
LCE2B-201ENST00000368780 TOPBP1Q92547 1522 aa34.68■■■■□ 3.14
LCE2B-201ENST00000368780 ABCC8Q09428 1581 aa34.62■■■■□ 3.13
LCE2B-201ENST00000368780 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.62■■■■□ 3.13
LCE2B-201ENST00000368780 IFT140Q96RY7 1462 aa34.52■■■■□ 3.12
LCE2B-201ENST00000368780 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
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LCE2B-201ENST00000368780 CUX1P39880 1505 aa34.34■■■■□ 3.09
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LCE2B-201ENST00000368780 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.24■■■■□ 3.07
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LCE2B-201ENST00000368780 OSCARQ8IYS5 282 aa34.07■■■■□ 3.04
LCE2B-201ENST00000368780 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.05■■■■□ 3.04
LCE2B-201ENST00000368780 WDR97A6NE52 1622 aa33.98■■■■□ 3.03
LCE2B-201ENST00000368780 SYNJ1O43426 1573 aa33.98■■■■□ 3.03
LCE2B-201ENST00000368780 TOP2BQ02880 1626 aa33.97■■■■□ 3.03
LCE2B-201ENST00000368780 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.95■■■■□ 3.03
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LCE2B-201ENST00000368780 FBLN2P98095 1184 aa33.86■■■■□ 3.01
LCE2B-201ENST00000368780 GRIN2BQ13224 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
LCE2B-201ENST00000368780 CHD1O14646 1710 aa33.84■■■■□ 3.01
LCE2B-201ENST00000368780 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.83■■■■□ 3.01
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LCE2B-201ENST00000368780 SYNJ2O15056 1496 aa33.67■■■□□ 2.98
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LCE2B-201ENST00000368780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.55■■■□□ 2.96
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LCE2B-201ENST00000368780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.55■■■□□ 2.96
LCE2B-201ENST00000368780 ARHGEF11O15085 1522 aa33.53■■■□□ 2.96
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LCE2B-201ENST00000368780 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.48■■■□□ 2.95
LCE2B-201ENST00000368780 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.47■■■□□ 2.95
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LCE2B-201ENST00000368780 GRIN2AQ12879 1464 aa33.43■■■□□ 2.94
LCE2B-201ENST00000368780 KIF27Q86VH2 1401 aa33.35■■■□□ 2.93
LCE2B-201ENST00000368780 CEP170Q5SW79 1584 aa33.27■■■□□ 2.92
LCE2B-201ENST00000368780 NUP160Q12769 1436 aa33.26■■■□□ 2.91
LCE2B-201ENST00000368780 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.25■■■□□ 2.91
LCE2B-201ENST00000368780 ARAP1Q96P48 1450 aa33.25■■■□□ 2.91
LCE2B-201ENST00000368780 IGF1RP08069 1367 aa33.21■■■□□ 2.91
LCE2B-201ENST00000368780 CUL7Q14999 1698 aa33.14■■■□□ 2.9
LCE2B-201ENST00000368780 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.03■■■□□ 2.88
LCE2B-201ENST00000368780 SHROOM2Q13796 1616 aa33.02■■■□□ 2.88
LCE2B-201ENST00000368780 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.02■■■□□ 2.88
LCE2B-201ENST00000368780 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.01■■■□□ 2.88
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