RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.38■■□□□ 1.33
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PRRX1-202ENST00000367760 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
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PRRX1-202ENST00000367760 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.29■■□□□ 1.32
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PRRX1-202ENST00000367760 A2MP01023 1474 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRX1-202ENST00000367760 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.24■■□□□ 1.31
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PRRX1-202ENST00000367760 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23■■□□□ 1.27
PRRX1-202ENST00000367760 TMF1P82094 1093 aa23■■□□□ 1.27
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PRRX1-202ENST00000367760 IQGAP1P46940 1657 aa22.96■■□□□ 1.27
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PRRX1-202ENST00000367760 INSRP06213 1382 aa22.88■■□□□ 1.25
PRRX1-202ENST00000367760 SLC24A1O60721 1099 aa22.86■■□□□ 1.25
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PRRX1-202ENST00000367760 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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