RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 KDM5DQ9BY66 1539 aa12□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 STRCQ7RTU9 1775 aa12□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 NPATQ14207 1427 aa11.99□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 TSPY4P0CV99 314 aa11.98□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 TSPY10P0CW01 314 aa11.98□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 GGT6Q6P531 493 aa11.98□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 ZMYM3Q14202 1370 aa11.97□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.96□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 CEP152O94986 1710 aa11.96□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.96□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 DAPK1P53355 1430 aa11.95□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRKQ15262 1439 aa11.95□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 KIF3BO15066 747 aa11.95□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC5O15440 1437 aa11.94□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 DEPDC5O75140 1603 aa11.93□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.93□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 KCNA4P22459 653 aa11.93□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 PZPP20742 1482 aa11.93□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC3O15438 1527 aa11.92□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 KIF15Q9NS87 1388 aa11.92□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 ERBINQ96RT1 1412 aa11.91□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 NCOA1Q15788 1441 aa11.9□□□□□ -0.5
SGMS1-201ENST00000361543 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.89□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 CERKQ8TCT0 537 aa11.89□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.89□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRL2O95490 1459 aa11.89□□□□□ -0.51
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SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.87□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2R1Q13018 1463 aa11.87□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.87□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.86□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRTO14522 1441 aa11.86□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP1Q9C000 1473 aa11.85□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.85□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-7P63135 1459 aa11.84□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.84□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.84□□□□□ -0.51
SGMS1-201ENST00000361543 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.83□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.83□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.82□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.81□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.81□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 KANK1Q14678 1352 aa11.81□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 UNC13BO14795 1591 aa11.81□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.8□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.8□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.8□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.79□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 TET3O43151 1660 aa11.79□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 ILDR2Q71H61 639 aa11.79□□□□□ -0.52
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SGMS1-201ENST00000361543 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.79□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3C2BO00750 1634 aa11.78□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 IQGAP1P46940 1657 aa11.78□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 PKD2Q13563 968 aa11.78□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
SGMS1-201ENST00000361543 SYNMO15061 1565 aa11.77□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 ROCK1Q13464 1354 aa11.77□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.77□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.76□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 SOCS7O14512 581 aa11.75□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 MED14O60244 1454 aa11.74□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.74□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 E9PCH4 1651 aa11.74□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.73□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRB3O60242 1522 aa11.72□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 SLIT1O75093 1534 aa11.72□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 ITGAEP38570 1179 aa11.72□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.71□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 NOS1P29475 1434 aa11.71□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.71□□□□□ -0.53
SGMS1-201ENST00000361543 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.69□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.69□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 CPS1P31327 1500 aa11.69□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.69□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 MSH5O43196 834 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-201ENST00000361543 NUP155O75694 1391 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 NAIPQ13075 1403 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 IDI1Q13907 227 aa11.64□□□□□ -0.55
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