RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.98■□□□□ 0.63
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.04■□□□□ 0.32
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC9O60706 1549 aa16.72■□□□□ 0.27
SGMS1-201ENST00000361543 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SGMS1-201ENST00000361543 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.06■□□□□ 0.16
SGMS1-201ENST00000361543 NACADO15069 1562 aa15.99■□□□□ 0.15
SGMS1-201ENST00000361543 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.91■□□□□ 0.14
SGMS1-201ENST00000361543 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.83■□□□□ 0.12
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.82■□□□□ 0.12
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SGMS1-201ENST00000361543 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.79■□□□□ 0.12
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.71■□□□□ 0.11
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.68■□□□□ 0.1
SGMS1-201ENST00000361543 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.58■□□□□ 0.09
SGMS1-201ENST00000361543 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
SGMS1-201ENST00000361543 SCRIBQ14160 1630 aa15.5■□□□□ 0.07
SGMS1-201ENST00000361543 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.4■□□□□ 0.06
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-201ENST00000361543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-201ENST00000361543 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.04■□□□□ -0
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCA4P51532 1647 aa14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-201ENST00000361543 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCA2P51531 1590 aa14.72□□□□□ -0.05
SGMS1-201ENST00000361543 NCAPD3P42695 1498 aa14.7□□□□□ -0.06
SGMS1-201ENST00000361543 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.7□□□□□ -0.06
SGMS1-201ENST00000361543 HMGXB3Q12766 1538 aa14.69□□□□□ -0.06
SGMS1-201ENST00000361543 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-201ENST00000361543 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-201ENST00000361543 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.58□□□□□ -0.08
SGMS1-201ENST00000361543 WIZO95785 1651 aa14.5□□□□□ -0.09
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC6Q03468 1493 aa14.44□□□□□ -0.1
SGMS1-201ENST00000361543 NESP48681 1621 aa14.43□□□□□ -0.1
SGMS1-201ENST00000361543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.41□□□□□ -0.1
SGMS1-201ENST00000361543 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SGMS1-201ENST00000361543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.35□□□□□ -0.11
SGMS1-201ENST00000361543 CUX2O14529 1486 aa14.34□□□□□ -0.11
SGMS1-201ENST00000361543 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SGMS1-201ENST00000361543 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
SGMS1-201ENST00000361543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.25□□□□□ -0.13
SGMS1-201ENST00000361543 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.25□□□□□ -0.13
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM2Q13029 1718 aa14.21□□□□□ -0.14
SGMS1-201ENST00000361543 CFTRP13569 1480 aa14.16□□□□□ -0.14
SGMS1-201ENST00000361543 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.15□□□□□ -0.14
SGMS1-201ENST00000361543 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.15□□□□□ -0.14
SGMS1-201ENST00000361543 WDR62O43379 1518 aa14.14□□□□□ -0.15
SGMS1-201ENST00000361543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.13□□□□□ -0.15
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.11□□□□□ -0.15
SGMS1-201ENST00000361543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
SGMS1-201ENST00000361543 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SGMS1-201ENST00000361543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.9□□□□□ -0.18
SGMS1-201ENST00000361543 TOPBP1Q92547 1522 aa13.9□□□□□ -0.19
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC8Q09428 1581 aa13.87□□□□□ -0.19
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM41Q8WV44 630 aa13.84□□□□□ -0.19
SGMS1-201ENST00000361543 IFT140Q96RY7 1462 aa13.83□□□□□ -0.2
SGMS1-201ENST00000361543 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
SGMS1-201ENST00000361543 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
SGMS1-201ENST00000361543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SGMS1-201ENST00000361543 CUX1P39880 1505 aa13.74□□□□□ -0.21
SGMS1-201ENST00000361543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.71□□□□□ -0.21
SGMS1-201ENST00000361543 WDR97A6NE52 1622 aa13.7□□□□□ -0.22
SGMS1-201ENST00000361543 CHD1O14646 1710 aa13.69□□□□□ -0.22
SGMS1-201ENST00000361543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.68□□□□□ -0.22
SGMS1-201ENST00000361543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
SGMS1-201ENST00000361543 SOGA1O94964 1423 aa13.66□□□□□ -0.22
SGMS1-201ENST00000361543 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.64□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 OSCARQ8IYS5 282 aa13.63□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 PBRM1Q86U86 1689 aa13.63□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 TOP2BQ02880 1626 aa13.61□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 SYNJ1O43426 1573 aa13.6□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.59□□□□□ -0.23
SGMS1-201ENST00000361543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.57□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.56□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.56□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.56□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.56□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 GRIN2BQ13224 1484 aa13.55□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.54□□□□□ -0.24
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF11O15085 1522 aa13.51□□□□□ -0.25
SGMS1-201ENST00000361543 FBLN2P98095 1184 aa13.5□□□□□ -0.25
SGMS1-201ENST00000361543 SYNJ2O15056 1496 aa13.49□□□□□ -0.25
SGMS1-201ENST00000361543 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.48□□□□□ -0.25
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS12P58397 1594 aa13.46□□□□□ -0.25
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SGMS1-201ENST00000361543 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.42□□□□□ -0.26
SGMS1-201ENST00000361543 GRIN2AQ12879 1464 aa13.4□□□□□ -0.26
SGMS1-201ENST00000361543 ARAP1Q96P48 1450 aa13.38□□□□□ -0.27
SGMS1-201ENST00000361543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.36□□□□□ -0.27
SGMS1-201ENST00000361543 CEP170Q5SW79 1584 aa13.36□□□□□ -0.27
SGMS1-201ENST00000361543 NUP160Q12769 1436 aa13.32□□□□□ -0.28
SGMS1-201ENST00000361543 CUL7Q14999 1698 aa13.32□□□□□ -0.28
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.31□□□□□ -0.28
SGMS1-201ENST00000361543 SHROOM2Q13796 1616 aa13.31□□□□□ -0.28
SGMS1-201ENST00000361543 KIF27Q86VH2 1401 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms