RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.17■■■□□ 2.42
SPHK1-201ENST00000323374 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.16■■■□□ 2.42
SPHK1-201ENST00000323374 PLA2R1Q13018 1463 aa30.15■■■□□ 2.42
SPHK1-201ENST00000323374 FANCAO15360 1455 aa30.14■■■□□ 2.42
SPHK1-201ENST00000323374 AFAP1Q8N556 730 aa30.14■■■□□ 2.42
SPHK1-201ENST00000323374 ASXL2Q76L83 1435 aa30.13■■■□□ 2.41
SPHK1-201ENST00000323374 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.13■■■□□ 2.41
SPHK1-201ENST00000323374 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.12■■■□□ 2.41
SPHK1-201ENST00000323374 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SPHK1-201ENST00000323374 ATP10AO60312 1499 aa30.1■■■□□ 2.41
SPHK1-201ENST00000323374 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SPHK1-201ENST00000323374 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.08■■■□□ 2.41
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SPHK1-201ENST00000323374 ADGRL1O94910 1474 aa30.03■■■□□ 2.4
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SPHK1-201ENST00000323374 ATP7AQ04656 1500 aa30.02■■■□□ 2.4
SPHK1-201ENST00000323374 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.01■■■□□ 2.4
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SPHK1-201ENST00000323374 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.96■■■□□ 2.39
SPHK1-201ENST00000323374 DEPDC5O75140 1603 aa29.96■■■□□ 2.39
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SPHK1-201ENST00000323374 CCDC184Q52MB2 194 aa29.91■■■□□ 2.38
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SPHK1-201ENST00000323374 TRPM2O94759 1503 aa29.87■■■□□ 2.37
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SPHK1-201ENST00000323374 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.86■■■□□ 2.37
SPHK1-201ENST00000323374 KIF3BO15066 747 aa29.86■■■□□ 2.37
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.86■■■□□ 2.37
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SPHK1-201ENST00000323374 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.85■■■□□ 2.37
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SPHK1-201ENST00000323374 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.82■■■□□ 2.36
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SPHK1-201ENST00000323374 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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SPHK1-201ENST00000323374 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.79■■■□□ 2.36
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SPHK1-201ENST00000323374 CEP152O94986 1710 aa29.76■■■□□ 2.35
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SPHK1-201ENST00000323374 NEFLP07196 543 aa29.75■■■□□ 2.35
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SPHK1-201ENST00000323374 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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SPHK1-201ENST00000323374 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.66■■■□□ 2.34
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SPHK1-201ENST00000323374 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.65■■■□□ 2.34
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SPHK1-201ENST00000323374 TMF1P82094 1093 aa29.62■■■□□ 2.33
SPHK1-201ENST00000323374 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.61■■■□□ 2.33
SPHK1-201ENST00000323374 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
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SPHK1-201ENST00000323374 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.47■■■□□ 2.31
SPHK1-201ENST00000323374 NPATQ14207 1427 aa29.46■■■□□ 2.31
SPHK1-201ENST00000323374 PANK3Q9H999 370 aa29.45■■■□□ 2.31
SPHK1-201ENST00000323374 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
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SPHK1-201ENST00000323374 NLRP13Q86W25 1043 aa29.43■■■□□ 2.3
SPHK1-201ENST00000323374 ABCC3O15438 1527 aa29.42■■■□□ 2.3
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