RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.22■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.21■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.2■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 PLCH2O75038 1416 aa38.17■■■■□ 3.7
UBP1-201ENST00000283628 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
UBP1-201ENST00000283628 CARD11Q9BXL7 1154 aa38.11■■■■□ 3.69
UBP1-201ENST00000283628 OSCARQ8IYS5 282 aa38.1■■■■□ 3.69
UBP1-201ENST00000283628 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.08■■■■□ 3.69
UBP1-201ENST00000283628 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.06■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.06■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 POLR3GLQ9BT43 218 aa38.05■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 PLXNC1O60486 1568 aa38.04■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 FANCIQ9NVI1 1328 aa38.02■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.02■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 ABCC1P33527 1531 aa38.02■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 E9PCH4 1651 aa38.01■■■■□ 3.68
UBP1-201ENST00000283628 UNC13BO14795 1591 aa37.99■■■■□ 3.67
UBP1-201ENST00000283628 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.97■■■■□ 3.67
UBP1-201ENST00000283628 NUDCQ9Y266 331 aa37.96■■■■□ 3.67
UBP1-201ENST00000283628 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.95■■■■□ 3.67
UBP1-201ENST00000283628 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.94■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.92■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.92■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.91■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 RNF123Q5XPI4 1314 aa37.9■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 TMC1Q8TDI8 760 aa37.9■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.9■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
UBP1-201ENST00000283628 RALBP1Q15311 655 aa37.88■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.87■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 LAMC1P11047 1609 aa37.87■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 ASXL2Q76L83 1435 aa37.86■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.85■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.85■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa37.84■■■■□ 3.65
UBP1-201ENST00000283628 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
UBP1-201ENST00000283628 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.8■■■■□ 3.64
UBP1-201ENST00000283628 ERBINQ96RT1 1412 aa37.79■■■■□ 3.64
UBP1-201ENST00000283628 MSH5O43196 834 aa37.78■■■■□ 3.64
UBP1-201ENST00000283628 PLA2R1Q13018 1463 aa37.77■■■■□ 3.64
UBP1-201ENST00000283628 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.75■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 FANCAO15360 1455 aa37.74■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 A2MP01023 1474 aa37.74■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.74■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 ATP10AO60312 1499 aa37.73■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.7■■■■□ 3.63
UBP1-201ENST00000283628 PARD3Q8TEW0 1356 aa37.68■■■■□ 3.62
UBP1-201ENST00000283628 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
UBP1-201ENST00000283628 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
UBP1-201ENST00000283628 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.62
UBP1-201ENST00000283628 NLRP13Q86W25 1043 aa37.64■■■■□ 3.62
UBP1-201ENST00000283628 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.62■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 AFAP1Q8N556 730 aa37.62■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 ADGRL1O94910 1474 aa37.6■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 RGL3Q3MIN7 710 aa37.6■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.617e-7■■■□□ 15.8
UBP1-201ENST00000283628 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.59■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 ATP7AQ04656 1500 aa37.57■■■■□ 3.61
UBP1-201ENST00000283628 CCDC136Q96JN2 1154 aa37.56■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.56■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.54■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 INSRP06213 1382 aa37.54■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 ERICH6Q7L0X2 663 aa37.52■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 TESK2Q96S53 571 aa37.52■■■■□ 3.6
UBP1-201ENST00000283628 PDE3BQ13370 1112 aa37.51■■■■□ 3.59
UBP1-201ENST00000283628 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.49■■■■□ 3.59
UBP1-201ENST00000283628 DEPDC5O75140 1603 aa37.48■■■■□ 3.59
UBP1-201ENST00000283628 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.48■■■■□ 3.59
UBP1-201ENST00000283628 CD109Q6YHK3 1445 aa37.44■■■■□ 3.58
UBP1-201ENST00000283628 TMF1P82094 1093 aa37.43■■■■□ 3.58
UBP1-201ENST00000283628 RRP1P56182 461 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
UBP1-201ENST00000283628 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa37.39■■■■□ 3.58
UBP1-201ENST00000283628 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.38■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.37■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 MADDQ8WXG6 1647 aa37.37■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 RCAN3Q9UKA8 241 aa37.36■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.36■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 IQGAP1P46940 1657 aa37.35■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 PANK3Q9H999 370 aa37.35■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 TRPM2O94759 1503 aa37.34■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 CEP152O94986 1710 aa37.32■■■■□ 3.57
UBP1-201ENST00000283628 STAC3Q96MF2 364 aa37.32■■■■□ 3.56
UBP1-201ENST00000283628 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.31■■■■□ 3.56
UBP1-201ENST00000283628 TET3O43151 1660 aa37.31■■■■□ 3.56
UBP1-201ENST00000283628 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.3■■■■□ 3.56
UBP1-201ENST00000283628 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
UBP1-201ENST00000283628 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.27■■■■□ 3.56
UBP1-201ENST00000283628 PTPRTO14522 1441 aa37.25■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.25■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 NEO1Q92859 1461 aa37.24■■■■□ 3.55
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