RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.41■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 IQGAP1P46940 1657 aa27.41■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 MED14O60244 1454 aa27.41■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.4■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 TNRQ92752 1358 aa27.38■■□□□ 1.97
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.38■■□□□ 1.97
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.36■■□□□ 1.97
SPCS1-201ENST00000233025 PZPP20742 1482 aa27.36■■□□□ 1.97
SPCS1-201ENST00000233025 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SPCS1-201ENST00000233025 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SPCS1-201ENST00000233025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.976e-7■■■■□ 24.4
SPCS1-201ENST00000233025 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.32■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.32■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.31■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.31■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP1Q9C000 1473 aa27.29■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.28■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SPCS1-201ENST00000233025 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.26■■□□□ 1.95
SPCS1-201ENST00000233025 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SPCS1-201ENST00000233025 MIA2Q96PC5 1412 aa27.22■■□□□ 1.95
SPCS1-201ENST00000233025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SPCS1-201ENST00000233025 POTEAQ6S8J7 498 aa27.2■■□□□ 1.94
SPCS1-201ENST00000233025 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SPCS1-201ENST00000233025 MBD5Q9P267 1494 aa27.19■■□□□ 1.94
SPCS1-201ENST00000233025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.19■■□□□ 1.94
SPCS1-201ENST00000233025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.16■■□□□ 1.94
SPCS1-201ENST00000233025 TIAM1Q13009 1591 aa27.14■■□□□ 1.93
SPCS1-201ENST00000233025 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.1■■□□□ 1.93
SPCS1-201ENST00000233025 KIF3BO15066 747 aa27.1■■□□□ 1.93
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SPCS1-201ENST00000233025 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.08■■□□□ 1.93
SPCS1-201ENST00000233025 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
SPCS1-201ENST00000233025 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.05■■□□□ 1.92
SPCS1-201ENST00000233025 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.01■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC3O15438 1527 aa27■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-7P63135 1459 aa27■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 NCOA2Q15596 1464 aa26.98■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.98■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.97■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 SLIT1O75093 1534 aa26.96■■□□□ 1.91
SPCS1-201ENST00000233025 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.94■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 CEP152O94986 1710 aa26.93■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K1Q13233 1512 aa26.93■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 PHLPP1O60346 1717 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 LTKP29376 864 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS1-201ENST00000233025 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 CEP162Q5TB80 1403 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM94Q12767 1356 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.81■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3C2BO00750 1634 aa26.8■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.79■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 JCADQ9P266 1359 aa26.79■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 NWD1Q149M9 1564 aa26.79■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.78■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 LRP6O75581 1613 aa26.77■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SPCS1-201ENST00000233025 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SPCS1-201ENST00000233025 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SPCS1-201ENST00000233025 TET3O43151 1660 aa26.74■■□□□ 1.87
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.72■■□□□ 1.87
SPCS1-201ENST00000233025 EID1Q9Y6B2 187 aa26.72■■□□□ 1.87
SPCS1-201ENST00000233025 KCNA6P17658 529 aa26.71■■□□□ 1.87
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.7■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 SHPRHQ149N8 1683 aa26.69■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM52Q96A61 297 aa26.67■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.66■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 TSPY4P0CV99 314 aa26.66■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 TSPY10P0CW01 314 aa26.66■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.65■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 MSH6P52701 1360 aa26.65■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.63■■□□□ 1.85
SPCS1-201ENST00000233025 SLAIN2Q9P270 581 aa26.62■■□□□ 1.85
SPCS1-201ENST00000233025 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SPCS1-201ENST00000233025 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SPCS1-201ENST00000233025 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.6■■□□□ 1.85
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS1-201ENST00000233025 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRB3O60242 1522 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS1-201ENST00000233025 RXRBP28702 533 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS1-201ENST00000233025 DIP2AQ14689 1571 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS1-201ENST00000233025 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.5■■□□□ 1.83
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