RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.48■■□□□ 1.03
POP4-201ENST00000221770 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
POP4-201ENST00000221770 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
POP4-201ENST00000221770 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.44■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.44■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 PLCH2O75038 1416 aa21.43■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.43■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.43■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 UNC13BO14795 1591 aa21.42■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.42■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.42■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 PLXNC1O60486 1568 aa21.41■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.39■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.39■■□□□ 1.02
POP4-201ENST00000221770 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.37■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 PLA2R1Q13018 1463 aa21.37■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 RGL3Q3MIN7 710 aa21.36■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.36■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 ERBINQ96RT1 1412 aa21.36■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.35■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
POP4-201ENST00000221770 ATP10AO60312 1499 aa21.31■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.31■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.29■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 A2MP01023 1474 aa21.29■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 ABCC1P33527 1531 aa21.29■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.29■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 TMC1Q8TDI8 760 aa21.29■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.29■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.28■■□□□ 1
POP4-201ENST00000221770 RALBP1Q15311 655 aa21.28■■□□□ 1
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POP4-201ENST00000221770 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.26■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.24■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.24■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.23■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 AFAP1Q8N556 730 aa21.22■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 LAMC1P11047 1609 aa21.21■□□□□ 0.99
POP4-201ENST00000221770 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 E9PCH4 1651 aa21.19■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 NUDCQ9Y266 331 aa21.18■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.17■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 TESK2Q96S53 571 aa21.17■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 TMF1P82094 1093 aa21.15■□□□□ 0.98
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POP4-201ENST00000221770 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.15■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.14■□□□□ 0.98
POP4-201ENST00000221770 NLRP13Q86W25 1043 aa21.13■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.13■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.12■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 FANCAO15360 1455 aa21.12■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 MSH5O43196 834 aa21.11■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 PTPRTO14522 1441 aa21.11■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 KANK1Q14678 1352 aa21.11■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 TRPM2O94759 1503 aa21.09■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.08■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.08■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 PANK3Q9H999 370 aa21.08■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.08■□□□□ 0.97
POP4-201ENST00000221770 ATP7AQ04656 1500 aa21.07■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.07■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 DEPDC5O75140 1603 aa21.07■□□□□ 0.96
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POP4-201ENST00000221770 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
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POP4-201ENST00000221770 ADGRL1O94910 1474 aa21.05■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 TET3O43151 1660 aa21.03■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 ASXL2Q76L83 1435 aa21.03■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.03■□□□□ 0.96
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POP4-201ENST00000221770 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.02■□□□□ 0.96
POP4-201ENST00000221770 CEP152O94986 1710 aa21■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 DEKP35659 375 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 SLC24A1O60721 1099 aa21■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 CDCA8Q53HL2 280 aa21■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 CLTCL1P53675 1640 aa21■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 PDE3BQ13370 1112 aa20.98■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 INSRP06213 1382 aa20.97■□□□□ 0.95
POP4-201ENST00000221770 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.97■□□□□ 0.95
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POP4-201ENST00000221770 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.95■□□□□ 0.94
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