RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173084.7

Ube2i-208, Transcript of SUMO-conjugating enzyme UBC9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2i, Length 1,286 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Caskin1Q6P9K8 1431 aa22.85■■□□□ 1.25
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Nos1Q9Z0J4 1429 aa22.85■■□□□ 1.25
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Rapgef3Q8VCC8 918 aa22.85■■□□□ 1.25
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Gm13697A2AK42 830 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Rims2Q9EQZ7 1530 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2i-208ENSMUST00000173084 PzpQ61838 1495 aa22.78■■□□□ 1.24
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Rsph4aQ8BYM7 716 aa22.72■■□□□ 1.23
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Naip5Q9R016 1403 aa22.69■■□□□ 1.22
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Fbln2P37889 1221 aa22.68■■□□□ 1.22
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Abcc6Q9R1S7 1498 aa22.67■■□□□ 1.22
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Uggt2E9Q4X2 1504 aa22.67■■□□□ 1.22
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Kif3bQ61771 747 aa22.66■■□□□ 1.22
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa22.64■■□□□ 1.22
Ube2i-208ENSMUST00000173084 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Fmn2Q9JL04 1578 aa22.61■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Ccnb3Q810T2 1396 aa22.61■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Naip1Q9QWK5 1403 aa22.58■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa22.58■■□□□ 1.21
Ube2i-208ENSMUST00000173084 HrcG5E8J6 738 aa22.57■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Plch2A2AP18 1501 aa22.57■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa22.55■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa22.54■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Prdm16A2A935 1275 aa22.54■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa22.52■■□□□ 1.2
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Hfm1D3Z4R1 1434 aa22.5■■□□□ 1.19
Ube2i-208ENSMUST00000173084 DnmbpQ6TXD4 1580 aa22.49■■□□□ 1.19
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Abca17E9PX95 1733 aa22.47■■□□□ 1.19
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Mast1Q9R1L5 1570 aa22.46■■□□□ 1.19
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Asxl1P59598 1514 aa22.46■■□□□ 1.19
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Tom1O88746 492 aa22.44■■□□□ 1.18
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Slit2Q9R1B9 1521 aa22.41■■□□□ 1.18
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Nyap1Q6PFX7 833 aa22.41■■□□□ 1.18
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Myo5cE9Q1F5 1742 aa22.4■■□□□ 1.18
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Amigo3Q8C2S7 508 aa22.39■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.39■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.37■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Cypt2Q6P924 180 aa22.36■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Adamts7Q68SA9 1657 aa22.36■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Med1Q925J9 1575 aa22.34■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Prex1Q69ZK0 1650 aa22.34■■□□□ 1.17
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa22.33■■□□□ 1.16
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa22.31■■□□□ 1.16
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.29■■□□□ 1.16
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Pik3c2aQ61194 1686 aa22.29■■□□□ 1.16
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Akap12Q9WTQ5 1684 aa22.26■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Abcc5Q9R1X5 1436 aa22.26■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Mbd5B1AYB6 1498 aa22.26■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Gimap5Q8BWF2 308 aa22.25■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.25■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Setd1aE9PYH6 1716 aa22.25■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Brinp3Q499E0 766 aa22.24■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.23■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Kif13aQ9EQW7 1749 aa22.23■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Vps8Q0P5W1 1427 aa22.23■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Txndc2Q6P902 515 aa22.21■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 NinlQ6ZQ12 1394 aa22.21■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa22.21■■□□□ 1.15
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Ssh2Q5SW75 1423 aa22.2■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa22.2■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa22.2■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa22.2■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Col18a1P39061 1774 aa22.2■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Zranb1Q7M760 708 aa22.19■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Fhad1A6PWD2 1420 aa22.19■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.19■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa22.18■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa22.18■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa22.16■■□□□ 1.14
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Adgrl1Q80TR1 1466 aa22.13■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Ildr2B5TVM2 661 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Sema6bO54951 886 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Cabp1Q9JLK7 227 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Qtrt2B8ZXI1 415 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ube2i-208ENSMUST00000173084 PtprvP70289 1705 aa22.08■■□□□ 1.12
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Myo3aQ8K3H5 1613 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Gm13695A2AK44 830 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Ttll13A4Q9F6 804 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Skint5A7XUY5 1461 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa22.06■■□□□ 1.12
Ube2i-208ENSMUST00000173084 Cntnap1O54991 1385 aa22.06■■□□□ 1.12
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