RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C MAL13P53338 473 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C PGA2P53903 129 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C VPS9P54787 451 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C ADD37Q03233 198 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C CCE1Q03702 353 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C YMR027WQ04371 470 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C MDM36Q06820 579 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C YKL068W-AQ3E826 78 aa4.04□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C YEL043WP32618 956 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C CSE2P33308 149 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C ATP3P38077 311 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C SIP3P38717 1229 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C GPI16P38875 610 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C SHC1P39000 512 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C YER079WP40052 210 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C NUP116Q02630 1113 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C NDE2Q07500 545 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C NSE1Q07913 336 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C PLP2Q12017 286 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C NCA2Q12374 616 aa4.03□□□□□ -1.76
PFA4YOL003C DST1P07273 309 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CKI1P20485 582 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C EXG1P23776 448 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C INM1P38710 295 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C LRP1P38801 184 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C COX14P39103 70 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YIL029CP40538 142 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C COS1P53822 381 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C MTQ1P53944 314 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C GYL1Q04322 720 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C NDL1Q06568 189 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YPR078CQ06813 372 aa4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C SPE3Q12074 293 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CDC21P06785 304 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CAP2P13517 287 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C HPR1P17629 752 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C HXT1P32465 570 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YKL097CP34245 136 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C TIS11P47977 285 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C MRM2P53123 320 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C SHY1P53266 389 aa4.01□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RAD1P06777 1100 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C DEP1P31385 405 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C SKN1P33336 771 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C MIC19P43594 170 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CWC22P53333 577 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C MRS2Q01926 470 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C FUS2Q05670 677 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C DAS2Q12084 232 aa4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CDC8P00572 216 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C MSI1P13712 422 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C GAB1P41733 394 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YLR297WQ05899 129 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C SFH1Q06168 426 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RNH203Q12338 110 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C JID1Q12350 301 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C AHC1Q12433 566 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C IZH2Q12442 317 aa3.99□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C NAM2P11325 894 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RPB5P20434 215 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YEF1P32622 495 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.98□□□□□ -1.77not detected
PFA4YOL003C QDR3P38227 689 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C LCB2P40970 561 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C STE24P47154 453 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C KAP114P53067 1004 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C LIF1P53150 421 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YGR117CP53270 476 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C VTI1Q04338 217 aa3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.97□□□□□ -1.77 RIP-Chip
PFA4YOL003C GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C YHR131CP38835 850 aa3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C FIS1P40515 155 aa3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RPC17P47076 161 aa3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C TIM8P57744 87 aa3.97□□□□□ -1.77
PFA4YOL003C RIF2Q06208 395 aa3.97□□□□□ -1.77
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