RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W UME6P39001 836 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W KRE29P40026 464 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W QRI7P43122 407 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W EXG2P52911 562 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YGR067CP53243 804 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YAT1P80235 687 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YSA1Q01976 231 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ABZ2Q03266 374 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YMR210WQ03649 449 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YMD8Q03697 442 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ARV1Q06541 321 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YOL073CQ08232 322 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BDS1Q08347 646 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TRM10Q12400 293 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W AI1P03875 834 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SAM35P14693 329 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PBN1P25580 416 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W VMA6P32366 345 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W DCG1P32460 244 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W HBS1P32769 611 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SEA4P38164 1038 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PEX18P38855 283 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SWP82P43554 623 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W CHA4P43634 648 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BAT2P47176 376 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W LCL3P53153 274 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W RNH1Q04740 348 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YOR214CQ12282 236 aa8.17□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W HIR2P32480 875 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W MAE1P36013 669 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SBE22P38814 852 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W VPS52P39904 641 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SPT20P50875 604 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W NCE101Q02820 53 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TRS23Q03784 219 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TPP1Q03796 238 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YLR446WQ06204 433 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SIA1Q12212 622 aa8.16□□□□□ -1.1
DDI1YER143W MET17P06106 444 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YOL162WP0CF19 215 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ENA1P13587 1091 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W GLK1P17709 500 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PMT2P31382 759 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ECM15P35195 104 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BAP2P38084 609 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W FAA3P39002 694 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ALR2P43553 858 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W APS3P47064 194 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W DBP6P53734 629 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ENA2Q01896 1091 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YKR011CQ02209 353 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ELP6Q04868 273 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W CDA2Q06703 312 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W GSH2Q08220 491 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TPO4Q12256 659 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PSF1Q12488 208 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ENA5Q12691 1091 aa8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W COX1P00401 534 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W HOM3P10869 527 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W OAC1P32332 324 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W LYP1P32487 611 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ECM4P36156 370 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W BAP3P41815 604 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W GCN20P43535 752 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RBG2P53295 368 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ASI1P54074 624 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ISU1Q03020 165 aa8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W DET1Q99288 334 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
DDI1YER143W TEL1P38110 2787 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W DPM1P14020 267 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YPT7P32939 208 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ARC19P33204 171 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W MCM7P38132 845 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W OSH7P38755 437 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RRP4P38792 359 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SNO3P43544 222 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RET2P43621 546 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ASK10P48361 1146 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SEH1P53011 349 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YGL235WP53071 178 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W COS1P53822 381 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms