RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	OM14	P38325	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	IES6	P32617	166 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	SPO23	P33757	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	MRP21	P38175	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	YBL028C	P38202	106 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	YHR177W	P38867	453 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	MRPL8	P22353	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	ABM1	P47146	123 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	HMS1	Q12398	434 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	COX4	P04037	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	EOS1	P53938	366 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	MSP1	P28737	362 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	DEP1	P31385	405 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	TIM17	P39515	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	SKS1	Q12505	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPC24	YMR117C	PRB1	P09232	635 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	ZRC1	P20107	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	PSO2	P30620	661 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	PSK1	P31374	1356 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YSW1	P38280	609 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	SEC9	P40357	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	PEX27	Q08580	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	STE7	P06784	515 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	MID2	P36027	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	DAD2	P36162	133 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	GPI18	P38211	433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	PFS1	P38872	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	MKC7	P53379	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	GIT1	P25346	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	RET3	P53600	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	SHS1	Q07657	551 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	FRE6	Q12473	712 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	MSK1	P32048	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	IGD1	P43598	195 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YPS5	P53057	165 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	MPS2	P53159	387 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	MSC3	Q05812	728 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	GAT3	Q07928	141 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	SNL1	P40548	159 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	KTR6	P54070	446 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	VHS1	Q03785	461 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	DAP2	P18962	818 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	CMK2	P22517	447 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	BMT2	P38278	337 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	KEG1	P43614	200 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	CIN2	P46670	268 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YNR068C	P53754	272 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	SFM1	Q12314	213 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPC24	YMR117C	HEM4	P06174	275 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	MAS2	P11914	482 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	VAM7	P32912	316 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	BLI1	P35727	113 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	SOL2	P37262	315 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	MRPS9	P38120	278 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	YHR182W	P38870	785 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	MCT1	Q12283	360 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	LDS1	P31379	325 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	DPH2	P32461	534 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	APE4	P38821	490 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	YGL262W	P53054	175 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	VHT1	P53241	593 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	VAC7	P53950	1165 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SPC24	YMR117C	YLH47	Q06493	454 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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