RNA–Protein interactions for RNA: YKL034W

TUL1, Transcript of Subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene TUL1, Length 2,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUL1	YKL034W	BUR2	Q05949	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	HIS5	P07172	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	CHO1	P08456	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	UPS2	P35200	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	QDR3	P38227	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SPC97	P38863	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	IKI1	P38874	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YAT2	P40017	923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MSE1	P48525	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	PEX10	Q05568	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	CPT1	P17898	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ITR2	P30606	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RRN10	P38204	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YBP1	P38315	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	GOS1	P38736	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YGR201C	P42936	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MSC1	Q03104	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YMD8	Q03697	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SYO1	Q07395	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MFG1	Q07684	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RIP1	P08067	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	EHD3	P28817	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	TIP20	P33891	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ICS2	P38284	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YER186C	P40101	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	GDS1	P41913	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	UBX6	P47049	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MOG1	P47123	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	JAC1	P53193	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SED5	Q01590	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	CYK3	Q07533	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	NSL1	Q12143	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RRI1	Q12468	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	KIN28	P06242	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ERG11	P10614	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	NAM2	P11325	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	DAL82	P21705	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ACH1	P32316	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MRPL7	P36519	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	BNA4	P38169	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	HIS2	P38635	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	FMP32	P43557	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SSY5	P47002	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	CDC14	Q00684	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	POM34	Q12445	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	HPM1	P40481	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	SBH2	P52871	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	DML1	Q03652	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	PET54	P10834	293 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	FZO1	P38297	855 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	TSC10	P38342	320 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YGR210C	P42942	411 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	DAP1	Q12091	152 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TUL1	YKL034W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	CSG2	P35206	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	ARA1	P38115	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	YBR242W	P38331	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	PAC2	P39937	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	PMT5	P52867	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	MGA1	P53050	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	KIN4	Q01919	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	NRG1	Q03125	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	PLB2	Q03674	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TUL1	YKL034W	COQ11	Q05892	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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