Protein–RNA interactions for Protein: P48525

MSE1, Glutamate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSE1P48525 NSR1YGR159C 1245 nt17.61■□□□□ 0.41
MSE1P48525 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.02■□□□□ 0.32
MSE1P48525 MDJ1YFL016C 1536 nt16.38■□□□□ 0.21
MSE1P48525 NOP1YDL014W 984 nt16.25■□□□□ 0.19
MSE1P48525 YJL027CYJL027C 417 nt15.01□□□□□ -0.01
MSE1P48525 YKL036CYKL036C 393 nt14.64□□□□□ -0.07
MSE1P48525 SSA3YBL075C 1950 nt14.58□□□□□ -0.07
MSE1P48525 SRX1YKL086W 384 nt14.23□□□□□ -0.13
MSE1P48525 DBP2YNL112W 1641 nt14.22□□□□□ -0.13
MSE1P48525 YBR190WYBR190W 312 nt14.17□□□□□ -0.14
MSE1P48525 Q0297Q0297 156 nt14.15□□□□□ -0.14
MSE1P48525 RTC3YHR087W 336 nt13.78□□□□□ -0.2
MSE1P48525 PUT4YOR348C 1884 nt13.51□□□□□ -0.25
MSE1P48525 YCR051WYCR051W 669 nt13.43□□□□□ -0.26
MSE1P48525 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.31□□□□□ -0.28
MSE1P48525 CCC1YLR220W 969 nt13.14□□□□□ -0.31
MSE1P48525 SCS3YGL126W 1143 nt13.13□□□□□ -0.31
MSE1P48525 RVS167YDR388W 1449 nt13.12□□□□□ -0.31
MSE1P48525 ARE1YCR048W 1833 nt13.02□□□□□ -0.32
MSE1P48525 POA1YBR022W 534 nt12.98□□□□□ -0.33
MSE1P48525 SPT5YML010W 3192 nt12.96□□□□□ -0.33
MSE1P48525 SCJ1YMR214W 1134 nt12.94□□□□□ -0.34
MSE1P48525 BSC6YOL137W 1494 nt12.86□□□□□ -0.35
MSE1P48525 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.83□□□□□ -0.36
MSE1P48525 SSA4YER103W 1929 nt12.83□□□□□ -0.36
MSE1P48525 SAH1YER043C 1350 nt12.75□□□□□ -0.37
MSE1P48525 YOL085CYOL085C 342 nt12.71□□□□□ -0.37
MSE1P48525 RPP1BYDL130W 321 nt12.67□□□□□ -0.38
MSE1P48525 URN1YPR152C 1398 nt12.64□□□□□ -0.39
MSE1P48525 OPI9YLR338W 858 nt12.62□□□□□ -0.39
MSE1P48525 PKP1YIL042C 1185 nt12.54□□□□□ -0.4
MSE1P48525 SHR5YOL110W 714 nt12.51□□□□□ -0.41
MSE1P48525 BDF1YLR399C 2061 nt12.46□□□□□ -0.41
MSE1P48525 BUD23YCR047C 828 nt12.44□□□□□ -0.42
MSE1P48525 DEP1YAL013W 1218 nt12.41□□□□□ -0.42
MSE1P48525 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.32□□□□□ -0.44
MSE1P48525 TAT1YBR069C 1860 nt12.26□□□□□ -0.45
MSE1P48525 RPN10YHR200W 807 nt12.24□□□□□ -0.45
MSE1P48525 PTC2YER089C 1395 nt12.23□□□□□ -0.45
MSE1P48525 PUN1YLR414C 792 nt12.22□□□□□ -0.45
MSE1P48525 NAB2YGL122C 1578 nt12.18□□□□□ -0.46
MSE1P48525 MEP2YNL142W 1500 nt12.17□□□□□ -0.46
MSE1P48525 PET122YER153C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
MSE1P48525 YNL208WYNL208W 600 nt12.12□□□□□ -0.47
MSE1P48525 PAC11YDR488C 1602 nt12.09□□□□□ -0.47
MSE1P48525 Q0182Q0182 405 nt12.02□□□□□ -0.49
MSE1P48525 YJR018WYJR018W 363 nt12□□□□□ -0.49
MSE1P48525 DCW1YKL046C 1350 nt11.96□□□□□ -0.49
MSE1P48525 FIS1YIL065C 468 nt11.96□□□□□ -0.49
MSE1P48525 YDJ1YNL064C 1230 nt11.93□□□□□ -0.5
MSE1P48525 SCR1SCR1 522 nt11.87□□□□□ -0.51
MSE1P48525 DAL1YIR027C 1383 nt11.87□□□□□ -0.51
MSE1P48525 YBR220CYBR220C 1683 nt11.85□□□□□ -0.51
MSE1P48525 YPS1YLR120C 1710 nt11.83□□□□□ -0.52
MSE1P48525 NVJ2YPR091C 2313 nt11.8□□□□□ -0.52
MSE1P48525 FPR4YLR449W 1179 nt11.79□□□□□ -0.52
MSE1P48525 EMI2YDR516C 1503 nt11.77□□□□□ -0.52
MSE1P48525 PHO4YFR034C 939 nt11.77□□□□□ -0.53
MSE1P48525 GAR1YHR089C 618 nt11.77□□□□□ -0.53
MSE1P48525 RRN5YLR141W 1092 nt11.76□□□□□ -0.53
MSE1P48525 YMR090WYMR090W 684 nt11.72□□□□□ -0.53
MSE1P48525 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.71□□□□□ -0.53
MSE1P48525 YJR120WYJR120W 351 nt11.7□□□□□ -0.54
MSE1P48525 INM2YDR287W 879 nt11.66□□□□□ -0.54
MSE1P48525 SDH1YKL148C 1923 nt11.64□□□□□ -0.55
MSE1P48525 YDL221WYDL221W 552 nt11.62□□□□□ -0.55
MSE1P48525 YDR095CYDR095C 411 nt11.62□□□□□ -0.55
MSE1P48525 ATS1YAL020C 1002 nt11.62□□□□□ -0.55
MSE1P48525 PCH2YBR186W 1695 nt11.6□□□□□ -0.55
MSE1P48525 GUT2YIL155C 1950 nt11.58□□□□□ -0.56
MSE1P48525 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.54□□□□□ -0.56
MSE1P48525 RPP2BYDR382W 333 nt11.52□□□□□ -0.57
MSE1P48525 CAC2YML102W 1407 nt11.52□□□□□ -0.57
MSE1P48525 SEC11YIR022W 504 nt11.5□□□□□ -0.57
MSE1P48525 MOT3YMR070W 1473 nt11.5□□□□□ -0.57
MSE1P48525 SSA1YAL005C 1929 nt11.48□□□□□ -0.57
MSE1P48525 PTP1YDL230W 1008 nt11.47□□□□□ -0.57
MSE1P48525 YBL100CYBL100C 315 nt11.44□□□□□ -0.58
MSE1P48525 SCC4YER147C 1875 nt11.44□□□□□ -0.58
MSE1P48525 TIR1YER011W 765 nt11.42□□□□□ -0.58
MSE1P48525 PIB2YGL023C 1908 nt11.42□□□□□ -0.58
MSE1P48525 RPP2AYOL039W 321 nt11.39□□□□□ -0.59
MSE1P48525 RSB1YOR049C 1065 nt11.37□□□□□ -0.59
MSE1P48525 IRC15YPL017C 1500 nt11.35□□□□□ -0.59
MSE1P48525 FPS1YLL043W 2010 nt11.33□□□□□ -0.6
MSE1P48525 GIS3YLR094C 1509 nt11.3□□□□□ -0.6
MSE1P48525 FUN26YAL022C 1554 nt11.28□□□□□ -0.6
MSE1P48525 YSC84YHR016C 1407 nt11.27□□□□□ -0.6
MSE1P48525 ALF1YNL148C 765 nt11.25□□□□□ -0.61
MSE1P48525 RTF1YGL244W 1677 nt11.23□□□□□ -0.61
MSE1P48525 YHL050CYHL050C 2094 nt11.22□□□□□ -0.61
MSE1P48525 BDH2YAL061W 1254 nt11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms