RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C LAS21P40367 830 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data5.38□□□□□ -1.55not detected
RRP4YHR069C DIM1P41819 318 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C HOC1P47124 396 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C CDH1P53197 566 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C GPI1P53306 609 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YGR266WP53326 701 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ERG13P54839 491 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RHO4Q00246 291 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SVL3Q03088 825 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C GAD1Q04792 585 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C GMC2Q06201 188 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ARR1Q06596 294 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C TEN1Q07921 160 aa5.38□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C BCY1P07278 416 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C GAL3P13045 520 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YAK1P14680 807 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C CBS2P14905 389 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C DAL82P21705 255 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SIN4P32259 974 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C NUP2P32499 720 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C UGP1P32861 499 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C TAF14P35189 244 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C MDJ1P35191 511 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C MRPL15P36523 253 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RPS27BP38711 82 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YHR177WP38867 453 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C FAA2P39518 744 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C PRP39P39682 629 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C FAU1P40099 211 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RIC1P40395 1056 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C STE24P47154 453 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ERP6P53198 216 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YGR012WP53206 393 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SPR6Q01684 191 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YKU80Q04437 629 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C GPI11Q06636 219 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C THI72Q08579 599 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C BSC1Q12140 328 aa5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C FLP1P03870 423 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C CMK2P22517 447 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C CDC12P32468 407 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C MKK1P32490 508 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C PTR2P32901 601 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C LHP1P33399 275 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RIB1P38066 345 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YBR241CP38142 488 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ALG14P38242 237 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C LEU5P38702 357 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ECM1P39715 212 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C GIP2P40036 548 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YFL066CP43538 392 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C PAC10P48363 199 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SAM37P50110 327 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C COS6P53344 381 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C OAZ1Q02803 292 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C UGO1Q03327 502 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SIZ1Q04195 904 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C COS7Q07788 383 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YLR036CQ07986 203 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ULA1Q12059 462 aa5.36□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C IRA1P18963 3092 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RAD7P06779 565 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C PUT2P07275 575 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RIP1P08067 215 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C MER1P16523 270 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C STE4P18851 423 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C STP22P25604 385 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YIM1P28625 365 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ARP2P32381 391 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C WBP1P33767 430 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C AST1P35183 429 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C CAB3P36076 571 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C FMP52P40008 231 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C MPM1P40364 252 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C LYS12P40495 371 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C JHD2P47156 728 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C TRM9P49957 279 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YGR079WP53249 370 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YNR068CP53754 272 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C TRS23Q03784 219 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C HFD1Q04458 532 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C THP1Q08231 455 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C SEC39Q12745 709 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C YOR019WQ99248 730 aa5.35□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C PEX3P28795 441 aa5.34□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C FAA1P30624 700 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RRP4YHR069C ATG14P38270 344 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.2 ms