Protein–RNA interactions for Protein: P39518

FAA2, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2, yeastyeast

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FAA2P39518 NSR1YGR159C 1245 nt19.33■□□□□ 0.68
FAA2P39518 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.07■□□□□ 0.64
FAA2P39518 NOP1YDL014W 984 nt18.35■□□□□ 0.53
FAA2P39518 MDJ1YFL016C 1536 nt17.59■□□□□ 0.41
FAA2P39518 YKL036CYKL036C 393 nt16.8■□□□□ 0.28
FAA2P39518 YJL027CYJL027C 417 nt16.18■□□□□ 0.18
FAA2P39518 SRX1YKL086W 384 nt16.03■□□□□ 0.16
FAA2P39518 Q0297Q0297 156 nt15.98■□□□□ 0.15
FAA2P39518 DBP2YNL112W 1641 nt15.39■□□□□ 0.05
FAA2P39518 SCS3YGL126W 1143 nt15.27■□□□□ 0.04
FAA2P39518 YCR051WYCR051W 669 nt15.21■□□□□ 0.03
FAA2P39518 YBR190WYBR190W 312 nt15.11■□□□□ 0.01
FAA2P39518 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.77□□□□□ -0.05
FAA2P39518 RTC3YHR087W 336 nt14.74□□□□□ -0.05
FAA2P39518 CCC1YLR220W 969 nt14.6□□□□□ -0.07
FAA2P39518 YOL085CYOL085C 342 nt14.58□□□□□ -0.08
FAA2P39518 SSA3YBL075C 1950 nt14.43□□□□□ -0.1
FAA2P39518 PKP1YIL042C 1185 nt14.43□□□□□ -0.1
FAA2P39518 RVS167YDR388W 1449 nt14.36□□□□□ -0.11
FAA2P39518 RPP1BYDL130W 321 nt14.35□□□□□ -0.11
FAA2P39518 SCJ1YMR214W 1134 nt14.21□□□□□ -0.13
FAA2P39518 PUT4YOR348C 1884 nt14.08□□□□□ -0.16
FAA2P39518 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FAA2P39518 PET122YER153C 765 nt13.78□□□□□ -0.2
FAA2P39518 SHR5YOL110W 714 nt13.76□□□□□ -0.21
FAA2P39518 ARE1YCR048W 1833 nt13.69□□□□□ -0.22
FAA2P39518 URN1YPR152C 1398 nt13.65□□□□□ -0.22
FAA2P39518 ATS1YAL020C 1002 nt13.6□□□□□ -0.23
FAA2P39518 POA1YBR022W 534 nt13.59□□□□□ -0.23
FAA2P39518 SAH1YER043C 1350 nt13.58□□□□□ -0.24
FAA2P39518 OPI9YLR338W 858 nt13.54□□□□□ -0.24
FAA2P39518 SCR1SCR1 522 nt13.54□□□□□ -0.24
FAA2P39518 DEP1YAL013W 1218 nt13.51□□□□□ -0.25
FAA2P39518 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.5□□□□□ -0.25
FAA2P39518 BSC6YOL137W 1494 nt13.39□□□□□ -0.27
FAA2P39518 YDJ1YNL064C 1230 nt13.36□□□□□ -0.27
FAA2P39518 RRN5YLR141W 1092 nt13.35□□□□□ -0.27
FAA2P39518 RPN10YHR200W 807 nt13.34□□□□□ -0.27
FAA2P39518 YNL208WYNL208W 600 nt13.25□□□□□ -0.29
FAA2P39518 BUD23YCR047C 828 nt13.15□□□□□ -0.3
FAA2P39518 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
FAA2P39518 PUN1YLR414C 792 nt13.14□□□□□ -0.31
FAA2P39518 SPT5YML010W 3192 nt13.1□□□□□ -0.31
FAA2P39518 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.09□□□□□ -0.31
FAA2P39518 RSB1YOR049C 1065 nt13.06□□□□□ -0.32
FAA2P39518 PTC2YER089C 1395 nt13.06□□□□□ -0.32
FAA2P39518 YJR018WYJR018W 363 nt12.99□□□□□ -0.33
FAA2P39518 SSA4YER103W 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
FAA2P39518 NAB2YGL122C 1578 nt12.95□□□□□ -0.34
FAA2P39518 FIS1YIL065C 468 nt12.74□□□□□ -0.37
FAA2P39518 TIR1YER011W 765 nt12.73□□□□□ -0.37
FAA2P39518 DAL1YIR027C 1383 nt12.7□□□□□ -0.38
FAA2P39518 YJR120WYJR120W 351 nt12.7□□□□□ -0.38
FAA2P39518 SSA1YAL005C 1929 nt12.67□□□□□ -0.38
FAA2P39518 FPR4YLR449W 1179 nt12.65□□□□□ -0.38
FAA2P39518 MEP2YNL142W 1500 nt12.62□□□□□ -0.39
FAA2P39518 RPP2BYDR382W 333 nt12.61□□□□□ -0.39
FAA2P39518 PST2YDR032C 597 nt12.6□□□□□ -0.39
FAA2P39518 INM2YDR287W 879 nt12.58□□□□□ -0.4
FAA2P39518 PHO4YFR034C 939 nt12.58□□□□□ -0.4
FAA2P39518 YPS1YLR120C 1710 nt12.5□□□□□ -0.41
FAA2P39518 BDF1YLR399C 2061 nt12.48□□□□□ -0.41
FAA2P39518 DCW1YKL046C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
FAA2P39518 YBL100CYBL100C 315 nt12.39□□□□□ -0.43
FAA2P39518 SRB2YHR041C 633 nt12.38□□□□□ -0.43
FAA2P39518 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.38□□□□□ -0.43
FAA2P39518 YDR095CYDR095C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
FAA2P39518 TAT1YBR069C 1860 nt12.32□□□□□ -0.44
FAA2P39518 BDH2YAL061W 1254 nt12.29□□□□□ -0.44
FAA2P39518 EMI2YDR516C 1503 nt12.24□□□□□ -0.45
FAA2P39518 FUN26YAL022C 1554 nt12.23□□□□□ -0.45
FAA2P39518 YMR090WYMR090W 684 nt12.22□□□□□ -0.45
FAA2P39518 YBR220CYBR220C 1683 nt12.17□□□□□ -0.46
FAA2P39518 SHU1YHL006C 453 nt12.16□□□□□ -0.46
FAA2P39518 ALF1YNL148C 765 nt12.15□□□□□ -0.46
FAA2P39518 TRM9YML014W 840 nt12.12□□□□□ -0.47
FAA2P39518 YDL221WYDL221W 552 nt12.11□□□□□ -0.47
FAA2P39518 PTP1YDL230W 1008 nt12.11□□□□□ -0.47
FAA2P39518 RPP2AYOL039W 321 nt12.11□□□□□ -0.47
FAA2P39518 CAC2YML102W 1407 nt12.1□□□□□ -0.47
FAA2P39518 WWM1YFL010C 636 nt12.09□□□□□ -0.47
FAA2P39518 YKL097CYKL097C 411 nt12.07□□□□□ -0.48
FAA2P39518 SDH1YKL148C 1923 nt12.05□□□□□ -0.48
FAA2P39518 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.04□□□□□ -0.48
FAA2P39518 LSM3YLR438C-A 270 nt12.04□□□□□ -0.48
FAA2P39518 CCT6YDR188W 1641 nt12.04□□□□□ -0.48
FAA2P39518 SIS1YNL007C 1059 nt11.98□□□□□ -0.49
FAA2P39518 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.96□□□□□ -0.49
FAA2P39518 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.96□□□□□ -0.49
FAA2P39518 IRC15YPL017C 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
FAA2P39518 SCC4YER147C 1875 nt11.91□□□□□ -0.5
FAA2P39518 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.9□□□□□ -0.5
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