RNA–Protein interactions for RNA: YMR078C

CTF18, Transcript of Subunit of a complex with Ctf8p, yeast

Gene CTF18, Length 2,226 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF18	YMR078C	IKS1	P47042	667 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	FMS1	P50264	508 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	ARK1	P53974	638 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RRT2	P38332	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	YGL082W	P53155	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	VAM3	Q12241	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	CPR2	P23285	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SIN4	P32259	974 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	ARA1	P38115	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	URB2	P47108	1174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	ECM27	P47144	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	YGL138C	P53122	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	GYP6	P32806	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	PXA2	P34230	853 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	VHC1	P38329	1120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SKO1	Q02100	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	IRC15	Q02733	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	MMR1	Q06324	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	HIR2	P32480	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	TFB1	P32776	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	TRS85	P46944	698 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	ACL4	Q03771	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	DAP1	Q12091	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	HAT2	P39984	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SAS2	P40963	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	GCD10	P41814	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SAD1	P43589	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	KRE2	P27809	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	NDC1	P32500	655 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SLM4	P38247	162 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SER3	P40054	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	GWT1	P47026	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	HSP31	Q04432	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
CTF18	YMR078C	BEM1	P29366	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	YJL070C	P40361	888 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RPR2	P40571	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RTT101	P47050	842 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	NDD1	Q08887	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	URA4	P20051	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	PTR2	P32901	601 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	FRE2	P36033	711 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	VPS74	Q06385	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	HIP1	P06775	603 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	EXO70	P19658	623 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	RHB1	P25378	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	AYT1	Q12226	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	GPM3	Q12326	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF18	YMR078C	SPC110	P32380	944 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	GRS2	Q06817	618 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	CLN1	P20437	546 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	CBP4	P37267	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RRT5	P43607	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	CIK1	Q01649	594 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	UAF30	Q08747	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SHO1	P40073	367 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SNM1	P40993	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	TOM22	P49334	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	HOT1	Q03213	719 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	COX3	P00420	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ECM25	P32525	599 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PEX5	P35056	612 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	LCB2	P40970	561 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PCP1	P53259	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	OCA2	P53949	197 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SOR2	Q07786	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	HEM2	P05373	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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