RNA–Protein interactions for RNA: YBR114W

RAD16, Transcript of Nucleotide excision repair (NER) protein, yeast

Gene RAD16, Length 2,373 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD16	YBR114W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PPH22	P23595	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
RAD16	YBR114W	IRE1	P32361	1115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PDR3	P33200	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	GPT2	P36148	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PPS1	P38148	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YHL008C	P38750	627 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	FMO1	P38866	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ECM10	P39987	644 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	CFD1	P40558	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	DOC1	P53068	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YGR026W	P53217	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	TGL2	P54857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	EEB1	Q02891	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ARG7	Q04728	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	FRT1	Q99332	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	HSF1	P10961	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	MLS1	P30952	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SCM4	P32564	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	MAC1	P35192	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	COS8	P38723	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YHR045W	P38775	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	GIC1	P38785	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ERV46	P39727	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YJR120W	P47157	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	AIM14	P53109	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SED5	Q01590	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ACL4	Q03771	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PRC1	P00729	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	COS2	P0CX12	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	COS3	P0CX13	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PDX1	P16451	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	FPS1	P23900	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	MNE1	P24720	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	LIP5	P32875	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SHP1	P34223	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RPC25	P35718	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	HES1	P35843	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	FIG1	P38224	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SLM4	P38247	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SHG1	P38337	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	BZZ1	P38822	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PSF2	P40359	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	EFM4	P40516	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	LSB6	P42951	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ALR2	P43553	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SWC4	P53201	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YGR017W	P53210	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PUS6	P53294	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	COQ6	P53318	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PRM15	Q03262	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SKY1	Q03656	742 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	IMA2	Q08295	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YOP1	Q12402	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	FLO1	P32768	1537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SNF3	P10870	884 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	TOP3	P13099	656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	AMS1	P22855	1083 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	KAE1	P36132	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	BET3	P36149	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YPK3	P38070	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YBR139W	P38109	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	UBS1	P38290	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ERP5	P38819	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	GPB2	P39717	880 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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