RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT4	YGR063C	DNF1	P32660	1571 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	MSH3	P25336	1018 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	SWI3	P32591	825 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	MED8	P38304	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	SSP1	P38871	571 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	EPS1	P40557	701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	RNT1	Q02555	471 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	VPS60	Q03390	229 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
SPT4	YGR063C	ECM1	P39715	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	VPS72	Q03388	795 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YLR271W	Q06152	274 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	VPS15	P22219	1454 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	ESC2	Q06340	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	BDF1	P35817	686 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	TEA1	P47988	759 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YNL050C	P53952	270 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	ATG2	P53855	1592 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	MET5	P47169	1442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	AI2	P03876	854 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RAD2	P07276	1031 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	CLB1	P24868	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	CLB5	P30283	435 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	DEP1	P31385	405 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	SAP190	P36123	1033 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RKM3	P38222	552 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	BBC1	P47068	1157 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	LCD1	Q04377	747 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YVC1	Q12324	675 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RAD51	P25454	400 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	STU2	P46675	888 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	DOS2	P54858	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	HAP5	Q02516	242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	ERV41	Q04651	352 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
SPT4	YGR063C	RAD3	P06839	778 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	SWE1	P32944	819 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	MRS2	Q01926	470 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	VPS30	Q02948	557 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	SEC39	Q12745	709 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	RPO31	P04051	1460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	TGL3	P40308	642 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	COG8	Q04632	607 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT4	YGR063C	YBT1	P32386	1661 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	CEP3	P40969	608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
SPT4	YGR063C	GRX3	Q03835	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	MDM38	Q08179	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	KAR3	P17119	729 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	SWH1	P35845	1188 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	PBY1	P38254	753 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	RSC1	P53236	928 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	SML1	Q04964	104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	CAT8	P39113	1433 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	MSH1	P25846	959 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	RTT107	P38850	1070 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	IFH1	P39520	1085 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	ITC1	P53125	1264 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	ALD3	P54114	506 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	TLG1	Q03322	224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	SFI1	Q12369	946 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	MCM2	P29469	868 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SPT4	YGR063C	NDC80	P40460	691 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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