RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 PLIN1O60240 522 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 RALBP1Q15311 655 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.83■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 NLRP13Q86W25 1043 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 MORC1Q86VD1 984 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 PDE4AP27815 886 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 C14orf37Q86TY3 774 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 PLCB2Q00722 1185 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 HSCBQ8IWL3 235 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 POGKQ9P215 609 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA2Q08379 1002 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 APBB1O00213 710 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 SMARCA4P51532 1647 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 SMARCA2P51531 1590 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 CASC1Q6TDU7 716 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 SOX12O15370 315 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 MS4A1P11836 297 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 CRBNQ96SW2 442 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 KIF21BO75037 1637 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 PDE3BQ13370 1112 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 PANK3Q9H999 370 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 STK26Q9P289 416 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 USP47Q96K76 1375 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 GGT6Q6P531 493 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 KIF15Q9NS87 1388 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 ARID3AQ99856 593 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 IGF1RP08069 1367 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC7Q96M83 1385 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC184Q52MB2 194 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 GSE1Q14687 1217 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 ARAP1Q96P48 1450 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 FAM161AQ3B820 660 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 USP35Q9P2H5 1018 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 COG6Q9Y2V7 657 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 APAF1O14727 1248 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 A0A0G2JS52 829 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 ERCC6Q03468 1493 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 KANK1Q14678 1352 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 GBP4Q96PP9 640 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.52■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 KIF3BO15066 747 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 KCNJ4P48050 445 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 UACAQ9BZF9 1416 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 MLECQ14165 292 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.46■□□□□ 0.71
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