RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613390.1

TULP4-204, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene TULP4, Length 804 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-204ENST00000613390 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TULP4-204ENST00000613390 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.21■■□□□ 1.63
TULP4-204ENST00000613390 FANCAO15360 1455 aa25.19■■□□□ 1.62
TULP4-204ENST00000613390 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.18■■□□□ 1.62
TULP4-204ENST00000613390 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TULP4-204ENST00000613390 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.17■■□□□ 1.62
TULP4-204ENST00000613390 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.17■■□□□ 1.62
TULP4-204ENST00000613390 MIA2Q96PC5 1412 aa25.17■■□□□ 1.62
TULP4-204ENST00000613390 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.14■■□□□ 1.61
TULP4-204ENST00000613390 AKNAQ7Z591 1439 aa25.12■■□□□ 1.61
TULP4-204ENST00000613390 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.08■■□□□ 1.61
TULP4-204ENST00000613390 ADGRL1O94910 1474 aa25.06■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.05■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.04■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 ABCC1P33527 1531 aa25.02■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.02■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.02■■□□□ 1.6
TULP4-204ENST00000613390 KDM6BO15054 1643 aa25.01■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.99■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.98■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.97■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.95■■□□□ 1.59
TULP4-204ENST00000613390 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.95■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.93■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 RICTORQ6R327 1708 aa24.93■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.91■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 MBD5Q9P267 1494 aa24.91■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.9■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.9■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 KDM5CP41229 1560 aa24.89■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
TULP4-204ENST00000613390 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.89■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 RAPGEF3O95398 923 aa24.87■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.86■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.86■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 TSPY4P0CV99 314 aa24.86■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 TSPY10P0CW01 314 aa24.86■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 AFAP1Q8N556 730 aa24.84■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.84■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TULP4-204ENST00000613390 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.82■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.82■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.8■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 DAPK1P53355 1430 aa24.79■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 ABCC5O15440 1437 aa24.78■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.77■■□□□ 1.56
TULP4-204ENST00000613390 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.76■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 ATP7AQ04656 1500 aa24.76■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.74■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.74■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.73■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.73■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 ATP10AO60312 1499 aa24.7■■□□□ 1.55
TULP4-204ENST00000613390 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.69■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 PLXNC1O60486 1568 aa24.69■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 REREQ9P2R6 1566 aa24.69■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 ADGRL2O95490 1459 aa24.69■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.69■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 ROCK1Q13464 1354 aa24.68■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.66■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.65■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 ABCA6Q8N139 1617 aa24.64■■□□□ 1.54
TULP4-204ENST00000613390 NCOA1Q15788 1441 aa24.63■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 A2MP01023 1474 aa24.61■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.61■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 AGLP35573 1532 aa24.6■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 KIF15Q9NS87 1388 aa24.59■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 PTPRKQ15262 1439 aa24.59■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 ITGAEP38570 1179 aa24.58■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.58■■□□□ 1.53
TULP4-204ENST00000613390 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TULP4-204ENST00000613390 ERBINQ96RT1 1412 aa24.55■■□□□ 1.52
TULP4-204ENST00000613390 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TULP4-204ENST00000613390 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TULP4-204ENST00000613390 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.53■■□□□ 1.52
TULP4-204ENST00000613390 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.53■■□□□ 1.52
TULP4-204ENST00000613390 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.5■■□□□ 1.51
TULP4-204ENST00000613390 HFM1A2PYH4 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
TULP4-204ENST00000613390 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.49■■□□□ 1.51
TULP4-204ENST00000613390 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TULP4-204ENST00000613390 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.46■■□□□ 1.51
TULP4-204ENST00000613390 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.45■■□□□ 1.5
TULP4-204ENST00000613390 NAIPQ13075 1403 aa24.44■■□□□ 1.5
TULP4-204ENST00000613390 KIF3BO15066 747 aa24.43■■□□□ 1.5
TULP4-204ENST00000613390 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TULP4-204ENST00000613390 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.39■■□□□ 1.5
TULP4-204ENST00000613390 DEPDC5O75140 1603 aa24.37■■□□□ 1.49
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