RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613390.1

TULP4-204, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene TULP4, Length 804 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-204ENST00000613390 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.68■■■■□ 3.78
TULP4-204ENST00000613390 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.29■■■■□ 3.08
TULP4-204ENST00000613390 ABCC9O60706 1549 aa32.91■■■□□ 2.86
TULP4-204ENST00000613390 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
TULP4-204ENST00000613390 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.16■■■□□ 2.74
TULP4-204ENST00000613390 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.15■■■□□ 2.74
TULP4-204ENST00000613390 NACADO15069 1562 aa32.13■■■□□ 2.73
TULP4-204ENST00000613390 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
TULP4-204ENST00000613390 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.01■■■□□ 2.71
TULP4-204ENST00000613390 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.18■■■□□ 2.58
TULP4-204ENST00000613390 SCRIBQ14160 1630 aa31.13■■■□□ 2.57
TULP4-204ENST00000613390 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.92■■■□□ 2.54
TULP4-204ENST00000613390 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.89■■■□□ 2.54
TULP4-204ENST00000613390 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
TULP4-204ENST00000613390 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TULP4-204ENST00000613390 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TULP4-204ENST00000613390 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.96■■■□□ 2.39
TULP4-204ENST00000613390 SMARCA4P51532 1647 aa29.9■■■□□ 2.38
TULP4-204ENST00000613390 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.85■■■□□ 2.37
TULP4-204ENST00000613390 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.73■■■□□ 2.35
TULP4-204ENST00000613390 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.73■■■□□ 2.35
TULP4-204ENST00000613390 SMARCA2P51531 1590 aa29.71■■■□□ 2.35
TULP4-204ENST00000613390 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.69■■■□□ 2.34
TULP4-204ENST00000613390 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.62■■■□□ 2.33
TULP4-204ENST00000613390 NCAPD3P42695 1498 aa29.61■■■□□ 2.33
TULP4-204ENST00000613390 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TULP4-204ENST00000613390 HMGXB3Q12766 1538 aa29.51■■■□□ 2.32
TULP4-204ENST00000613390 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TULP4-204ENST00000613390 WIZO95785 1651 aa29.42■■■□□ 2.3
TULP4-204ENST00000613390 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TULP4-204ENST00000613390 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TULP4-204ENST00000613390 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.85■■■□□ 2.21
TULP4-204ENST00000613390 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.77■■■□□ 2.2
TULP4-204ENST00000613390 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.75■■■□□ 2.19
TULP4-204ENST00000613390 CFTRP13569 1480 aa28.66■■■□□ 2.18
TULP4-204ENST00000613390 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.58■■■□□ 2.17
TULP4-204ENST00000613390 NESP48681 1621 aa28.58■■■□□ 2.17
TULP4-204ENST00000613390 PRDM2Q13029 1718 aa28.52■■■□□ 2.16
TULP4-204ENST00000613390 ERCC6Q03468 1493 aa28.42■■■□□ 2.14
TULP4-204ENST00000613390 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.38■■■□□ 2.13
TULP4-204ENST00000613390 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.33■■■□□ 2.13
TULP4-204ENST00000613390 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.32■■■□□ 2.12
TULP4-204ENST00000613390 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.19■■■□□ 2.1
TULP4-204ENST00000613390 ABCC8Q09428 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
TULP4-204ENST00000613390 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
TULP4-204ENST00000613390 WDR62O43379 1518 aa28.08■■■□□ 2.09
TULP4-204ENST00000613390 CUX2O14529 1486 aa28.04■■■□□ 2.08
TULP4-204ENST00000613390 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.02■■■□□ 2.08
TULP4-204ENST00000613390 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TULP4-204ENST00000613390 TOPBP1Q92547 1522 aa27.97■■■□□ 2.07
TULP4-204ENST00000613390 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
TULP4-204ENST00000613390 CUX1P39880 1505 aa27.88■■■□□ 2.05
TULP4-204ENST00000613390 TOP2BQ02880 1626 aa27.84■■■□□ 2.05
TULP4-204ENST00000613390 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.83■■■□□ 2.05
TULP4-204ENST00000613390 SYNJ1O43426 1573 aa27.75■■■□□ 2.03
TULP4-204ENST00000613390 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
TULP4-204ENST00000613390 IFT140Q96RY7 1462 aa27.75■■■□□ 2.03
TULP4-204ENST00000613390 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.74■■■□□ 2.03
TULP4-204ENST00000613390 SOGA1O94964 1423 aa27.67■■■□□ 2.02
TULP4-204ENST00000613390 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
TULP4-204ENST00000613390 WDR97A6NE52 1622 aa27.61■■■□□ 2.01
TULP4-204ENST00000613390 TRIM41Q8WV44 630 aa27.58■■■□□ 2.01
TULP4-204ENST00000613390 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.56■■■□□ 2
TULP4-204ENST00000613390 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.55■■■□□ 2
TULP4-204ENST00000613390 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.47■■□□□ 1.99
TULP4-204ENST00000613390 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
TULP4-204ENST00000613390 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TULP4-204ENST00000613390 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TULP4-204ENST00000613390 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.38■■□□□ 1.97
TULP4-204ENST00000613390 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.37■■□□□ 1.97
TULP4-204ENST00000613390 KIF27Q86VH2 1401 aa27.36■■□□□ 1.97
TULP4-204ENST00000613390 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.976e-6■■■■□ 25.1
TULP4-204ENST00000613390 GRIN2BQ13224 1484 aa27.33■■□□□ 1.97
TULP4-204ENST00000613390 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.27■■□□□ 1.96
TULP4-204ENST00000613390 PBRM1Q86U86 1689 aa27.26■■□□□ 1.95
TULP4-204ENST00000613390 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TULP4-204ENST00000613390 EEA1Q15075 1411 aa27.22■■□□□ 1.95
TULP4-204ENST00000613390 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.14■■□□□ 1.94
TULP4-204ENST00000613390 IGF1RP08069 1367 aa27.13■■□□□ 1.93
TULP4-204ENST00000613390 CUL7Q14999 1698 aa27.11■■□□□ 1.93
TULP4-204ENST00000613390 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.11■■□□□ 1.93
TULP4-204ENST00000613390 SYNJ2O15056 1496 aa27.1■■□□□ 1.93
TULP4-204ENST00000613390 ADAMTS12P58397 1594 aa27.07■■□□□ 1.92
TULP4-204ENST00000613390 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.05■■□□□ 1.92
TULP4-204ENST00000613390 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
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TULP4-204ENST00000613390 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27■■□□□ 1.91
TULP4-204ENST00000613390 CHD1O14646 1710 aa26.96■■□□□ 1.91
TULP4-204ENST00000613390 GRIN2AQ12879 1464 aa26.95■■□□□ 1.91
TULP4-204ENST00000613390 FBLN2P98095 1184 aa26.95■■□□□ 1.9
TULP4-204ENST00000613390 OSCARQ8IYS5 282 aa26.94■■□□□ 1.9
TULP4-204ENST00000613390 PRXQ9BXM0 1461 aa26.91■■□□□ 1.9
TULP4-204ENST00000613390 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.91■■□□□ 1.9
TULP4-204ENST00000613390 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TULP4-204ENST00000613390 NUP160Q12769 1436 aa26.82■■□□□ 1.88
TULP4-204ENST00000613390 KIF21BO75037 1637 aa26.8■■□□□ 1.88
TULP4-204ENST00000613390 CEP170Q5SW79 1584 aa26.73■■□□□ 1.87
TULP4-204ENST00000613390 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.72■■□□□ 1.87
TULP4-204ENST00000613390 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.71■■□□□ 1.87
TULP4-204ENST00000613390 GOLGA3Q08378 1498 aa26.68■■□□□ 1.86
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