RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.58■□□□□ 0.73
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RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRL1O94910 1474 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-209ENST00000607882 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
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RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPY4P0CV99 314 aa19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPY10P0CW01 314 aa19.19■□□□□ 0.66
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RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF5Q12774 1597 aa19■□□□□ 0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.99■□□□□ 0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.99■□□□□ 0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.99■□□□□ 0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 PLXNC1O60486 1568 aa18.97■□□□□ 0.63
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RABGEF1-209ENST00000607882 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
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