RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GMDS-AS1-216ENST00000607519 ROCK1Q13464 1354 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLXNC1O60486 1568 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 11.9
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.8■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.79■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NAIPQ13075 1403 aa15.79■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.78■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 REREQ9P2R6 1566 aa15.77■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.76■□□□□ 0.11
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GMDS-AS1-216ENST00000607519 HFM1A2PYH4 1435 aa15.74■□□□□ 0.11
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