RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.26■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.25■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.24■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FANCAO15360 1455 aa16.23■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AKNAQ7Z591 1439 aa16.23■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAPGEF3O95398 923 aa16.22■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PREX2Q70Z35 1606 aa16.21■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.21■□□□□ 0.19
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AFAP1Q8N556 730 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NEO1Q92859 1461 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.16■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADGRL1O94910 1474 aa16.16■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.15■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM6BO15054 1643 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MIA2Q96PC5 1412 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCC1P33527 1531 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MBD5Q9P267 1494 aa16.1■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.1■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ITGAEP38570 1179 aa16.09■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.09■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.08■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.08■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.08■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.07■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RICTORQ6R327 1708 aa16.07■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.05■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCC5O15440 1437 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PTPRKQ15262 1439 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPY4P0CV99 314 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPY10P0CW01 314 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RSPH4AQ5TD94 716 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DAPK1P53355 1430 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGEF5Q12774 1597 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM5CP41229 1560 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.96■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.96■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.94■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.94■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATP7AQ04656 1500 aa15.94■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCA6Q8N139 1617 aa15.93■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.92■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.92■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATP10AO60312 1499 aa15.91■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.91■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.91■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.91■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MLECQ14165 292 aa15.9■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.89■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.89■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NCOA1Q15788 1441 aa15.89■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.87■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.87■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF15Q9NS87 1388 aa15.87■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.86■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A2MP01023 1474 aa15.86■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF3BO15066 747 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADGRL2O95490 1459 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GGT6Q6P531 493 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ROCK1Q13464 1354 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLXNC1O60486 1568 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 11.9
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.8■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.79■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NAIPQ13075 1403 aa15.79■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.78■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-216ENST00000607519 REREQ9P2R6 1566 aa15.77■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.76■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.76■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AGLP35573 1532 aa15.76■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HFM1A2PYH4 1435 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms