RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.8■■■■■ 5.08
CAPNS1-206ENST00000588815 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCH2O75038 1416 aa46.76■■■■■ 5.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.73■■■■■ 5.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.67■■■■■ 5.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGAEP38570 1179 aa46.67■■■■■ 5.06
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.63■■■■■ 5.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CROCC2H7BZ55 1655 aa46.63■■■■■ 5.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GLI2P10070 1586 aa46.61■■■■■ 5.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.61■■■■■ 5.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DAPK1P53355 1430 aa46.61■■■■■ 5.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.6■■■■■ 5.05
CAPNS1-206ENST00000588815 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.57■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRKQ15262 1439 aa46.55■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC5O15440 1437 aa46.54■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.53■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.52■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.51■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 AKNAQ7Z591 1439 aa46.51■■■■■ 5.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.5■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.5■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DIP2BQ9P265 1576 aa46.49■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SHANK2Q9UPX8 1470 aa46.47■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CD109Q6YHK3 1445 aa46.47■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC1P33527 1531 aa46.46■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.46■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD5Q9P267 1494 aa46.46■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FANCAO15360 1455 aa46.45■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 GCC2Q8IWJ2 1684 aa46.45■■■■■ 5.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.44■■■■■ 5.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SETD5Q9C0A6 1442 aa46.44■■■■■ 5.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ROCK1Q13464 1354 aa46.43■■■■■ 5.02
CAPNS1-206ENST00000588815 HFM1A2PYH4 1435 aa46.43■■■■■ 5.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.42■■■■■ 5.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRL2O95490 1459 aa46.36■■■■■ 5.01
CAPNS1-206ENST00000588815 HRCP23327 699 aa46.33■■■■■ 5.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MAST1Q9Y2H9 1570 aa46.33■■■■■ 5.01
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.32■■■■■ 5.01
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.31■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 NAIPQ13075 1403 aa46.3■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.28■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPY4P0CV99 314 aa46.28■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPY10P0CW01 314 aa46.28■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.27■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 NEO1Q92859 1461 aa46.27■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.27■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 CHIC2Q9UKJ5 165 aa46.26■■■■■ 5
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRL1O94910 1474 aa46.24■■■■■ 4.99
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.22■■■■■ 4.99
CAPNS1-206ENST00000588815 NCOA1Q15788 1441 aa46.22■■■■■ 4.99
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa46.22■■■■■ 4.99
CAPNS1-206ENST00000588815 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
CAPNS1-206ENST00000588815 PLXNC1O60486 1568 aa46.14■■■■■ 4.98
CAPNS1-206ENST00000588815 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa46.14■■■■■ 4.98
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.13■■■■■ 4.97
CAPNS1-206ENST00000588815 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPOAP1O95153 1857 aa46.12■■■■■ 4.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.11■■■■■ 4.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.1■■■■■ 4.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.06■■■■■ 4.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.04■■■■■ 4.96
CAPNS1-206ENST00000588815 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM5CP41229 1560 aa45.98■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.98■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM6BO15054 1643 aa45.98■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.97■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF15Q9NS87 1388 aa45.96■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP7AQ04656 1500 aa45.93■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 RICTORQ6R327 1708 aa45.92■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa45.92■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 AFAP1Q8N556 730 aa45.92■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.9■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CLSPNQ9HAW4 1339 aa45.88■■■■■ 4.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.87■■■■■ 4.93
CAPNS1-206ENST00000588815 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.85■■■■■ 4.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
CAPNS1-206ENST00000588815 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.83■■■■■ 4.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ERBINQ96RT1 1412 aa45.79■■■■■ 4.92
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.72■■■■■ 4.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.71■■■■■ 4.91
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC13BO14795 1591 aa45.67■■■■■ 4.9
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.66■■■■■ 4.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM52Q96A61 297 aa45.66■■■■■ 4.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.62■■■■■ 4.89
CAPNS1-206ENST00000588815 RAPGEF3O95398 923 aa45.61■■■■■ 4.89
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.6■■■■■ 4.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA6Q8N139 1617 aa45.6■■■■■ 4.89
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
CAPNS1-206ENST00000588815 DEPDC5O75140 1603 aa45.54■■■■■ 4.88
CAPNS1-206ENST00000588815 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.53■■■■■ 4.88
CAPNS1-206ENST00000588815 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.53■■■■■ 4.88
CAPNS1-206ENST00000588815 A2MP01023 1474 aa45.53■■■■■ 4.88
CAPNS1-206ENST00000588815 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PZPP20742 1482 aa45.52■■■■■ 4.88
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