RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587385.6

PDCD2L-204, Transcript of programmed cell death 2 like, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD2L, Length 1,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2L-204ENST00000587385 NCOA2Q15596 1464 aa41.27■■■■■ 4.2
PDCD2L-204ENST00000587385 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
PDCD2L-204ENST00000587385 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.25■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.25■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.24■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.24■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 AKNAQ7Z591 1439 aa41.22■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
PDCD2L-204ENST00000587385 ADGRL1O94910 1474 aa41.1■■■■■ 4.17
PDCD2L-204ENST00000587385 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
PDCD2L-204ENST00000587385 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
PDCD2L-204ENST00000587385 RICTORQ6R327 1708 aa41.04■■■■■ 4.16
PDCD2L-204ENST00000587385 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.03■■■■■ 4.16
PDCD2L-204ENST00000587385 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.03■■■■■ 4.16
PDCD2L-204ENST00000587385 ABCC1P33527 1531 aa41.02■■■■■ 4.16
PDCD2L-204ENST00000587385 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41■■■■■ 4.15
PDCD2L-204ENST00000587385 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41■■■■■ 4.15
PDCD2L-204ENST00000587385 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.99■■■■■ 4.15
PDCD2L-204ENST00000587385 MIA2Q96PC5 1412 aa40.96■■■■■ 4.15
PDCD2L-204ENST00000587385 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.95■■■■■ 4.15
PDCD2L-204ENST00000587385 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.94■■■■■ 4.14
PDCD2L-204ENST00000587385 RAPGEF3O95398 923 aa40.94■■■■■ 4.14
PDCD2L-204ENST00000587385 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
PDCD2L-204ENST00000587385 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.9■■■■■ 4.14
PDCD2L-204ENST00000587385 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.9■■■■■ 4.14
PDCD2L-204ENST00000587385 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.89■■■■■ 4.14
PDCD2L-204ENST00000587385 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.87■■■■■ 4.13
PDCD2L-204ENST00000587385 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.85■■■■■ 4.13
PDCD2L-204ENST00000587385 KDM5CP41229 1560 aa40.85■■■■■ 4.13
PDCD2L-204ENST00000587385 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
PDCD2L-204ENST00000587385 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.82■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.81■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.79■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 MBD5Q9P267 1494 aa40.78■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.77■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 AFAP1Q8N556 730 aa40.76■■■■■ 4.12
PDCD2L-204ENST00000587385 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.75■■■■■ 4.11
PDCD2L-204ENST00000587385 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.74■■■■■ 4.11
PDCD2L-204ENST00000587385 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
PDCD2L-204ENST00000587385 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
PDCD2L-204ENST00000587385 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.72■■■■■ 4.11
PDCD2L-204ENST00000587385 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.72■■■■■ 4.11
PDCD2L-204ENST00000587385 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.69■■■■■ 4.1
PDCD2L-204ENST00000587385 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.68■■■■■ 4.1
PDCD2L-204ENST00000587385 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.66■■■■■ 4.1
PDCD2L-204ENST00000587385 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.63■■■■■ 4.1
PDCD2L-204ENST00000587385 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PDCD2L-204ENST00000587385 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PDCD2L-204ENST00000587385 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.59■■■■■ 4.09
PDCD2L-204ENST00000587385 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.57■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 ATP7AQ04656 1500 aa40.57■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.53■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 ATP10AO60312 1499 aa40.53■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.53■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 ABCA6Q8N139 1617 aa40.53■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.52■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.51■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 TSPY4P0CV99 314 aa40.51■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 TSPY10P0CW01 314 aa40.51■■■■■ 4.08
PDCD2L-204ENST00000587385 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 REREQ9P2R6 1566 aa40.49■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.47■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 ABCC5O15440 1437 aa40.46■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.45■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 DAPK1P53355 1430 aa40.45■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
PDCD2L-204ENST00000587385 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.43■■■■■ 4.06
PDCD2L-204ENST00000587385 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.37■■■■■ 4.05
PDCD2L-204ENST00000587385 PLXNC1O60486 1568 aa40.35■■■■■ 4.05
PDCD2L-204ENST00000587385 AGLP35573 1532 aa40.32■■■■■ 4.05
PDCD2L-204ENST00000587385 A2MP01023 1474 aa40.31■■■■■ 4.04
PDCD2L-204ENST00000587385 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.28■■■■■ 4.04
PDCD2L-204ENST00000587385 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PDCD2L-204ENST00000587385 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
PDCD2L-204ENST00000587385 ADGRL2O95490 1459 aa40.24■■■■■ 4.03
PDCD2L-204ENST00000587385 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.21■■■■■ 4.03
PDCD2L-204ENST00000587385 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.18■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 PTPRKQ15262 1439 aa40.18■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 NCOA1Q15788 1441 aa40.18■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.17■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.16■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 KIF15Q9NS87 1388 aa40.14■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 ROCK1Q13464 1354 aa40.13■■■■■ 4.02
PDCD2L-204ENST00000587385 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.13■■■■■ 4.01
PDCD2L-204ENST00000587385 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
PDCD2L-204ENST00000587385 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.08■■■■■ 4.01
PDCD2L-204ENST00000587385 ERBINQ96RT1 1412 aa40.07■■■■■ 4
PDCD2L-204ENST00000587385 ITGAEP38570 1179 aa40.05■■■■■ 4
PDCD2L-204ENST00000587385 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.05■■■■■ 4
PDCD2L-204ENST00000587385 MADDQ8WXG6 1647 aa40.03■■■■■ 4
PDCD2L-204ENST00000587385 MLECQ14165 292 aa40.03■■■■■ 4
PDCD2L-204ENST00000587385 KIF3BO15066 747 aa40■■■■□ 3.99
PDCD2L-204ENST00000587385 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
PDCD2L-204ENST00000587385 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.98■■■■□ 3.99
PDCD2L-204ENST00000587385 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
PDCD2L-204ENST00000587385 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.93■■■■□ 3.98
PDCD2L-204ENST00000587385 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms