RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
MEIS3-212ENST00000561293 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.9■■■□□ 2.86
MEIS3-212ENST00000561293 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
MEIS3-212ENST00000561293 PREX2Q70Z35 1606 aa32.88■■■□□ 2.85
MEIS3-212ENST00000561293 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.87■■■□□ 2.85
MEIS3-212ENST00000561293 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.86■■■□□ 2.85
MEIS3-212ENST00000561293 RAPGEF3O95398 923 aa32.83■■■□□ 2.85
MEIS3-212ENST00000561293 AKNAQ7Z591 1439 aa32.83■■■□□ 2.85
MEIS3-212ENST00000561293 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.8■■■□□ 2.84
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRL1O94910 1474 aa32.77■■■□□ 2.84
MEIS3-212ENST00000561293 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.77■■■□□ 2.84
MEIS3-212ENST00000561293 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.76■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 NEO1Q92859 1461 aa32.76■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.75■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.74■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.74■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 KDM6BO15054 1643 aa32.73■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.73■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 AFAP1Q8N556 730 aa32.71■■■□□ 2.83
MEIS3-212ENST00000561293 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.69■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.69■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.69■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.67■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.66■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC1P33527 1531 aa32.66■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
MEIS3-212ENST00000561293 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.62■■■□□ 2.81
MEIS3-212ENST00000561293 MIA2Q96PC5 1412 aa32.61■■■□□ 2.81
MEIS3-212ENST00000561293 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.6■■■□□ 2.81
MEIS3-212ENST00000561293 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.59■■■□□ 2.81
MEIS3-212ENST00000561293 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.57■■■□□ 2.8
MEIS3-212ENST00000561293 MBD5Q9P267 1494 aa32.57■■■□□ 2.8
MEIS3-212ENST00000561293 ITGAEP38570 1179 aa32.55■■■□□ 2.8
MEIS3-212ENST00000561293 RICTORQ6R327 1708 aa32.54■■■□□ 2.8
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.52■■■□□ 2.8
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.5■■■□□ 2.79
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.5■■■□□ 2.79
MEIS3-212ENST00000561293 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.48■■■□□ 2.79
MEIS3-212ENST00000561293 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
MEIS3-212ENST00000561293 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.47■■■□□ 2.79
MEIS3-212ENST00000561293 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC5O15440 1437 aa32.42■■■□□ 2.78
MEIS3-212ENST00000561293 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
MEIS3-212ENST00000561293 KDM5CP41229 1560 aa32.42■■■□□ 2.78
MEIS3-212ENST00000561293 DAPK1P53355 1430 aa32.39■■■□□ 2.78
MEIS3-212ENST00000561293 PTPRKQ15262 1439 aa32.37■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 TSPY4P0CV99 314 aa32.36■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 TSPY10P0CW01 314 aa32.36■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.36■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.36■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.35■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.33■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.33■■■□□ 2.77
MEIS3-212ENST00000561293 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.32■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 ATP7AQ04656 1500 aa32.31■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.31■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.3■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 ABCA6Q8N139 1617 aa32.29■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.29■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.27■■■□□ 2.76
MEIS3-212ENST00000561293 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.26■■■□□ 2.75
MEIS3-212ENST00000561293 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.24■■■□□ 2.75
MEIS3-212ENST00000561293 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.24■■■□□ 2.75
MEIS3-212ENST00000561293 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.23■■■□□ 2.75
MEIS3-212ENST00000561293 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
MEIS3-212ENST00000561293 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
MEIS3-212ENST00000561293 MLECQ14165 292 aa32.2■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 ATP10AO60312 1499 aa32.19■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.18■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.17■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 KIF15Q9NS87 1388 aa32.15■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.15■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 NCOA1Q15788 1441 aa32.14■■■□□ 2.74
MEIS3-212ENST00000561293 A2MP01023 1474 aa32.12■■■□□ 2.73
MEIS3-212ENST00000561293 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.12■■■□□ 2.73
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.11■■■□□ 2.73
MEIS3-212ENST00000561293 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
MEIS3-212ENST00000561293 PLXNC1O60486 1568 aa32.05■■■□□ 2.72
MEIS3-212ENST00000561293 KIF3BO15066 747 aa32.05■■■□□ 2.72
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRL2O95490 1459 aa32.05■■■□□ 2.72
MEIS3-212ENST00000561293 GGT6Q6P531 493 aa32.04■■■□□ 2.72
MEIS3-212ENST00000561293 ROCK1Q13464 1354 aa31.99■■■□□ 2.71
MEIS3-212ENST00000561293 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.97■■■□□ 2.71
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.95■■■□□ 2.71
MEIS3-212ENST00000561293 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.95■■■□□ 2.71
MEIS3-212ENST00000561293 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.95■■■□□ 2.71
MEIS3-212ENST00000561293 REREQ9P2R6 1566 aa31.95■■■□□ 2.7
MEIS3-212ENST00000561293 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.94■■■□□ 2.7
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
MEIS3-212ENST00000561293 NAIPQ13075 1403 aa31.94■■■□□ 2.7
MEIS3-212ENST00000561293 AGLP35573 1532 aa31.9■■■□□ 2.7
MEIS3-212ENST00000561293 ERBINQ96RT1 1412 aa31.88■■■□□ 2.69
MEIS3-212ENST00000561293 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-212ENST00000561293 HFM1A2PYH4 1435 aa31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-212ENST00000561293 MADDQ8WXG6 1647 aa31.83■■■□□ 2.69
MEIS3-212ENST00000561293 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.82■■■□□ 2.68
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