RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 PLCH2O75038 1416 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.22□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 CD109Q6YHK3 1445 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-220ENST00000550700 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 NEO1Q92859 1461 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-220ENST00000550700 FANCAO15360 1455 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 TSPOAP1O95153 1857 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 AKNAQ7Z591 1439 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 ABCC1P33527 1531 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.15
CS-220ENST00000550700 ADGRL1O94910 1474 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 TSPY4P0CV99 314 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 TSPY10P0CW01 314 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 MBD5Q9P267 1494 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 DAPK1P53355 1430 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.02□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.02□□□□□ -0.16
CS-220ENST00000550700 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 ABCC5O15440 1437 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 ROCK1Q13464 1354 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.01□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 POGZQ7Z3K3 1410 aa14□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 RICTORQ6R327 1708 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 KDM5CP41229 1560 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 ADGRL2O95490 1459 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 ITGAEP38570 1179 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 PLXNC1O60486 1568 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-220ENST00000550700 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.96□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 ATP7AQ04656 1500 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 HFM1A2PYH4 1435 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 HRCP23327 699 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 NCOA1Q15788 1441 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 AFAP1Q8N556 730 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 KDM6BO15054 1643 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 PTPRKQ15262 1439 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 RAPGEF3O95398 923 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-220ENST00000550700 KIF15Q9NS87 1388 aa13.88□□□□□ -0.19
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CS-220ENST00000550700 ERBINQ96RT1 1412 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 REREQ9P2R6 1566 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 ATP10AO60312 1499 aa13.85□□□□□ -0.19
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