RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBC-213	ENST00000546120	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBC-213	ENST00000546120	IGF1R	P08069	1367 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBC-213	ENST00000546120	PDE4A	P27815	886 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBC-213	ENST00000546120	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
UBC-213	ENST00000546120	PRDM2	Q13029	1718 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBC-213	ENST00000546120	NAIP	Q13075	1403 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	WDR62	O43379	1518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
UBC-213	ENST00000546120	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.39	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	RALBP1	Q15311	655 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.33	□□□□□ -0.27
UBC-213	ENST00000546120	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBC-213	ENST00000546120	BECN1	Q14457	450 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	AAMP	Q13685	434 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	CUL7	Q14999	1698 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	CLCN1	P35523	988 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBC-213	ENST00000546120	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.21	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	PTMS	P20962	102 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	TPM2	P07951	284 aa		13.19	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.18	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	TERF1	P54274	439 aa		13.18	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.17	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.15	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	USP47	Q96K76	1375 aa		13.15	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.15	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.15	□□□□□ -0.3
UBC-213	ENST00000546120	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.14	□□□□□ -0.31
UBC-213	ENST00000546120	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.14	□□□□□ -0.31
UBC-213	ENST00000546120	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBC-213	ENST00000546120	MRE11	P49959	708 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBC-213	ENST00000546120	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31

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