RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541586.5

CCM2-218, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCM2, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-218ENST00000541586 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.31■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 FANCAO15360 1455 aa42.28■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.28■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.26■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 PREX2Q70Z35 1606 aa42.24■■■■■ 4.35
CCM2-218ENST00000541586 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.23■■■■■ 4.35
CCM2-218ENST00000541586 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CCM2-218ENST00000541586 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.19■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.19■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 AKNAQ7Z591 1439 aa42.18■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 NEO1Q92859 1461 aa42.15■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.09■■■■■ 4.33
CCM2-218ENST00000541586 MIA2Q96PC5 1412 aa42.09■■■■■ 4.33
CCM2-218ENST00000541586 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.332e-6■■■□□ 15.7
CCM2-218ENST00000541586 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.07■■■■■ 4.33
CCM2-218ENST00000541586 ADGRL1O94910 1474 aa42.07■■■■■ 4.33
CCM2-218ENST00000541586 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.06■■■■■ 4.32
CCM2-218ENST00000541586 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CCM2-218ENST00000541586 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.04■■■■■ 4.32
CCM2-218ENST00000541586 RAPGEF3O95398 923 aa42.03■■■■■ 4.32
CCM2-218ENST00000541586 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.96■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 AFAP1Q8N556 730 aa41.95■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.95■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.94■■■■■ 4.3
CCM2-218ENST00000541586 ABCC1P33527 1531 aa41.93■■■■■ 4.3
CCM2-218ENST00000541586 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.93■■■■■ 4.3
CCM2-218ENST00000541586 KDM6BO15054 1643 aa41.92■■■■■ 4.3
CCM2-218ENST00000541586 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.91■■■■■ 4.3
CCM2-218ENST00000541586 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.89■■■■■ 4.3
CCM2-218ENST00000541586 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.86■■■■■ 4.29
CCM2-218ENST00000541586 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CCM2-218ENST00000541586 MBD5Q9P267 1494 aa41.84■■■■■ 4.29
CCM2-218ENST00000541586 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.83■■■■■ 4.29
CCM2-218ENST00000541586 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.82■■■■■ 4.294e-9■■■□□ 16.7
CCM2-218ENST00000541586 ITGAEP38570 1179 aa41.82■■■■■ 4.29
CCM2-218ENST00000541586 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.81■■■■■ 4.28
CCM2-218ENST00000541586 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.79■■■■■ 4.28
CCM2-218ENST00000541586 TSPY4P0CV99 314 aa41.77■■■■■ 4.28
CCM2-218ENST00000541586 TSPY10P0CW01 314 aa41.77■■■■■ 4.28
CCM2-218ENST00000541586 RICTORQ6R327 1708 aa41.74■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.73■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.72■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.69■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 ABCC5O15440 1437 aa41.69■■■■■ 4.26
CCM2-218ENST00000541586 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.69■■■■■ 4.26
CCM2-218ENST00000541586 DAPK1P53355 1430 aa41.68■■■■■ 4.26
CCM2-218ENST00000541586 KDM5CP41229 1560 aa41.63■■■■■ 4.25
CCM2-218ENST00000541586 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
CCM2-218ENST00000541586 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.57■■■■■ 4.25
CCM2-218ENST00000541586 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.56■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.56■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.56■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 PTPRKQ15262 1439 aa41.54■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.54■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 HRCP23327 699 aa41.52■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.52■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 ATP7AQ04656 1500 aa41.51■■■■■ 4.24
CCM2-218ENST00000541586 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.5■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.49■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.49■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.49■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.47■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.47■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
CCM2-218ENST00000541586 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.42■■■■■ 4.22
CCM2-218ENST00000541586 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.42■■■■■ 4.22
CCM2-218ENST00000541586 ABCA6Q8N139 1617 aa41.38■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 ATP10AO60312 1499 aa41.38■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 NCOA1Q15788 1441 aa41.37■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.37■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.36■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 KIF15Q9NS87 1388 aa41.35■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.33■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 ADGRL2O95490 1459 aa41.3■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 ROCK1Q13464 1354 aa41.29■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 A2MP01023 1474 aa41.29■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.28■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.27■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 PLXNC1O60486 1568 aa41.26■■■■■ 4.2
CCM2-218ENST00000541586 HFM1A2PYH4 1435 aa41.23■■■■■ 4.19
CCM2-218ENST00000541586 MLECQ14165 292 aa41.2■■■■■ 4.19
CCM2-218ENST00000541586 KIF3BO15066 747 aa41.19■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.19■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 NAIPQ13075 1403 aa41.15■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.13■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 GGT6Q6P531 493 aa41.13■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.13■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 REREQ9P2R6 1566 aa41.11■■■■■ 4.17
CCM2-218ENST00000541586 ERBINQ96RT1 1412 aa41.08■■■■■ 4.17
CCM2-218ENST00000541586 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms