RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540951.1

CADM1-210, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 3

Gene CADM1, Length 572 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-210ENST00000540951 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.13■■■□□ 2.41
CADM1-210ENST00000540951 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.11■■■□□ 2.41
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CADM1-210ENST00000540951 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.08■■■□□ 2.41
CADM1-210ENST00000540951 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
CADM1-210ENST00000540951 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CADM1-210ENST00000540951 ABCC1P33527 1531 aa30.03■■■□□ 2.4
CADM1-210ENST00000540951 FANCAO15360 1455 aa30.03■■■□□ 2.4
CADM1-210ENST00000540951 MIA2Q96PC5 1412 aa30.03■■■□□ 2.4
CADM1-210ENST00000540951 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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CADM1-210ENST00000540951 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.97■■■□□ 2.39
CADM1-210ENST00000540951 NEO1Q92859 1461 aa29.97■■■□□ 2.39
CADM1-210ENST00000540951 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.97■■■□□ 2.39
CADM1-210ENST00000540951 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CADM1-210ENST00000540951 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CADM1-210ENST00000540951 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.94■■■□□ 2.38
CADM1-210ENST00000540951 RICTORQ6R327 1708 aa29.94■■■□□ 2.38
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CADM1-210ENST00000540951 AKNAQ7Z591 1439 aa29.91■■■□□ 2.38
CADM1-210ENST00000540951 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.9■■■□□ 2.38
CADM1-210ENST00000540951 MBD5Q9P267 1494 aa29.89■■■□□ 2.38
CADM1-210ENST00000540951 ADGRL1O94910 1474 aa29.88■■■□□ 2.37
CADM1-210ENST00000540951 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.87■■■□□ 2.37
CADM1-210ENST00000540951 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CADM1-210ENST00000540951 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CADM1-210ENST00000540951 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.84■■■□□ 2.37
CADM1-210ENST00000540951 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.84■■■□□ 2.37
CADM1-210ENST00000540951 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.82■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.81■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 KDM5CP41229 1560 aa29.81■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.79■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.79■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.77■■■□□ 2.36
CADM1-210ENST00000540951 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.76■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 ABCC5O15440 1437 aa29.76■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 DAPK1P53355 1430 aa29.76■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 PTPRKQ15262 1439 aa29.76■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 KDM6BO15054 1643 aa29.75■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.75■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.75■■■□□ 2.35
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CADM1-210ENST00000540951 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.71■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.71■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.7■■■□□ 2.35
CADM1-210ENST00000540951 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.69■■■□□ 2.34
CADM1-210ENST00000540951 ABCA6Q8N139 1617 aa29.66■■■□□ 2.34
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CADM1-210ENST00000540951 PLXNC1O60486 1568 aa29.64■■■□□ 2.34
CADM1-210ENST00000540951 RAPGEF3O95398 923 aa29.63■■■□□ 2.33
CADM1-210ENST00000540951 AFAP1Q8N556 730 aa29.63■■■□□ 2.33
CADM1-210ENST00000540951 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.62■■■□□ 2.33
CADM1-210ENST00000540951 ADGRL2O95490 1459 aa29.61■■■□□ 2.33
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CADM1-210ENST00000540951 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.6■■■□□ 2.33
CADM1-210ENST00000540951 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.59■■■□□ 2.33
CADM1-210ENST00000540951 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.59■■■□□ 2.33
CADM1-210ENST00000540951 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.57■■■□□ 2.32
CADM1-210ENST00000540951 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CADM1-210ENST00000540951 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.54■■■□□ 2.32
CADM1-210ENST00000540951 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.54■■■□□ 2.32
CADM1-210ENST00000540951 ITGAEP38570 1179 aa29.53■■■□□ 2.32
CADM1-210ENST00000540951 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.52■■■□□ 2.32
CADM1-210ENST00000540951 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CADM1-210ENST00000540951 NCOA1Q15788 1441 aa29.49■■■□□ 2.31
CADM1-210ENST00000540951 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
CADM1-210ENST00000540951 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.48■■■□□ 2.31
CADM1-210ENST00000540951 ROCK1Q13464 1354 aa29.48■■■□□ 2.31
CADM1-210ENST00000540951 REREQ9P2R6 1566 aa29.43■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 NAIPQ13075 1403 aa29.42■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.42■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 HFM1A2PYH4 1435 aa29.41■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 TSPY4P0CV99 314 aa29.41■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 TSPY10P0CW01 314 aa29.41■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.4■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.39■■■□□ 2.3
CADM1-210ENST00000540951 KIF15Q9NS87 1388 aa29.39■■■□□ 2.3
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CADM1-210ENST00000540951 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.36■■■□□ 2.29
CADM1-210ENST00000540951 A2MP01023 1474 aa29.36■■■□□ 2.29
CADM1-210ENST00000540951 ATP10AO60312 1499 aa29.35■■■□□ 2.29
CADM1-210ENST00000540951 DEPDC5O75140 1603 aa29.33■■■□□ 2.29
CADM1-210ENST00000540951 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.32■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.31■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 UNC13BO14795 1591 aa29.3■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 ERBINQ96RT1 1412 aa29.29■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.28■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 AGLP35573 1532 aa29.27■■■□□ 2.28
CADM1-210ENST00000540951 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.25■■■□□ 2.27
CADM1-210ENST00000540951 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.25■■■□□ 2.27
CADM1-210ENST00000540951 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.22■■■□□ 2.27
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