RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.55■■■■■ 5.04
ACER3-214ENST00000534206 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.54■■■■■ 5.04
ACER3-214ENST00000534206 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.53■■■■■ 5.04
ACER3-214ENST00000534206 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.52■■■■■ 5.04
ACER3-214ENST00000534206 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.52■■■■■ 5.04
ACER3-214ENST00000534206 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.52■■■■■ 5.04
ACER3-214ENST00000534206 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
ACER3-214ENST00000534206 CLIP1P30622 1438 aa46.42■■■■■ 5.02
ACER3-214ENST00000534206 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.37■■■■■ 5.01
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ACER3-214ENST00000534206 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.34■■■■■ 5.01
ACER3-214ENST00000534206 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
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ACER3-214ENST00000534206 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.26■■■■■ 5
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ACER3-214ENST00000534206 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.22■■■■■ 4.99
ACER3-214ENST00000534206 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.22■■■■■ 4.99
ACER3-214ENST00000534206 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.21■■■■■ 4.99
ACER3-214ENST00000534206 MLECQ14165 292 aa46.21■■■■■ 4.99
ACER3-214ENST00000534206 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.15■■■■■ 4.98
ACER3-214ENST00000534206 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.14■■■■■ 4.98
ACER3-214ENST00000534206 ABCC1P33527 1531 aa46.13■■■■■ 4.98
ACER3-214ENST00000534206 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.09■■■■■ 4.97
ACER3-214ENST00000534206 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.09■■■■■ 4.97
ACER3-214ENST00000534206 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.09■■■■■ 4.97
ACER3-214ENST00000534206 PLPPR3Q6T4P5 718 aa46.05■■■■■ 4.96
ACER3-214ENST00000534206 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.04■■■■■ 4.96
ACER3-214ENST00000534206 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
ACER3-214ENST00000534206 ABCA6Q8N139 1617 aa46.03■■■■■ 4.96
ACER3-214ENST00000534206 REREQ9P2R6 1566 aa46.01■■■■■ 4.96
ACER3-214ENST00000534206 HSPA2P54652 639 aa45.96■■■■■ 4.95
ACER3-214ENST00000534206 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.95■■■■■ 4.95
ACER3-214ENST00000534206 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.94■■■■■ 4.94
ACER3-214ENST00000534206 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.93■■■■■ 4.94
ACER3-214ENST00000534206 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
ACER3-214ENST00000534206 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
ACER3-214ENST00000534206 AGLP35573 1532 aa45.87■■■■■ 4.93
ACER3-214ENST00000534206 CEP162Q5TB80 1403 aa45.86■■■■■ 4.93
ACER3-214ENST00000534206 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.83■■■■■ 4.93
ACER3-214ENST00000534206 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.82■■■■■ 4.931e-6■■■■■ 27.5
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ACER3-214ENST00000534206 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.77■■■■■ 4.92
ACER3-214ENST00000534206 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.77■■■■■ 4.92
ACER3-214ENST00000534206 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
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ACER3-214ENST00000534206 TIAM1Q13009 1591 aa45.68■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.67■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.66■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 C3P01024 1663 aa45.64■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 FBXO41Q8TF61 875 aa45.64■■■■■ 4.9
ACER3-214ENST00000534206 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
ACER3-214ENST00000534206 ATP7AQ04656 1500 aa45.62■■■■■ 4.89
ACER3-214ENST00000534206 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.6■■■■■ 4.89
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ACER3-214ENST00000534206 PLXNC1O60486 1568 aa45.54■■■■■ 4.88
ACER3-214ENST00000534206 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa45.52■■■■■ 4.88
ACER3-214ENST00000534206 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
ACER3-214ENST00000534206 CNTLNQ9NXG0 1405 aa45.5■■■■■ 4.87
ACER3-214ENST00000534206 A2MP01023 1474 aa45.49■■■■■ 4.87
ACER3-214ENST00000534206 STRCQ7RTU9 1775 aa45.49■■■■■ 4.87
ACER3-214ENST00000534206 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
ACER3-214ENST00000534206 NCOA2Q15596 1464 aa45.45■■■■■ 4.87
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ACER3-214ENST00000534206 MROH2AA6NES4 1674 aa45.39■■■■■ 4.86
ACER3-214ENST00000534206 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.37■■■■■ 4.85
ACER3-214ENST00000534206 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa45.35■■■■■ 4.85
ACER3-214ENST00000534206 ADGBQ8N7X0 1667 aa45.34■■■■■ 4.85
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ACER3-214ENST00000534206 NPATQ14207 1427 aa45.31■■■■■ 4.84
ACER3-214ENST00000534206 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
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ACER3-214ENST00000534206 GGT6Q6P531 493 aa45.29■■■■■ 4.84
ACER3-214ENST00000534206 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.27■■■■■ 4.84
ACER3-214ENST00000534206 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
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ACER3-214ENST00000534206 CCDC141Q6ZP82 1450 aa45.23■■■■■ 4.83
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ACER3-214ENST00000534206 PTPRKQ15262 1439 aa45.2■■■■■ 4.83
ACER3-214ENST00000534206 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.2■■■■■ 4.83
ACER3-214ENST00000534206 PTPRTO14522 1441 aa45.18■■■■■ 4.82
ACER3-214ENST00000534206 NCOA1Q15788 1441 aa45.18■■■■■ 4.82
ACER3-214ENST00000534206 RSPH4AQ5TD94 716 aa45.17■■■■■ 4.82
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ACER3-214ENST00000534206 MYO3AQ8NEV4 1616 aa45.04■■■■■ 4.8
ACER3-214ENST00000534206 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
ACER3-214ENST00000534206 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
ACER3-214ENST00000534206 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.97■■■■■ 4.79
ACER3-214ENST00000534206 TSPY4P0CV99 314 aa44.97■■■■■ 4.79
ACER3-214ENST00000534206 TSPY10P0CW01 314 aa44.97■■■■■ 4.79
ACER3-214ENST00000534206 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.96■■■■■ 4.79
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