RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527078.5

SLC52A2-208, Transcript of solute carrier family 52 member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SLC52A2, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC52A2-208ENST00000527078 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
SLC52A2-208ENST00000527078 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
SLC52A2-208ENST00000527078 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.39■■■■□ 3.42
SLC52A2-208ENST00000527078 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC52A2-208ENST00000527078 PLCH2O75038 1416 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC52A2-208ENST00000527078 PTPRKQ15262 1439 aa36.34■■■■□ 3.41
SLC52A2-208ENST00000527078 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.34■■■■□ 3.41
SLC52A2-208ENST00000527078 DIP2BQ9P265 1576 aa36.28■■■■□ 3.4
SLC52A2-208ENST00000527078 CD109Q6YHK3 1445 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC52A2-208ENST00000527078 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
SLC52A2-208ENST00000527078 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.21■■■■□ 3.39
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCC5O15440 1437 aa36.21■■■■□ 3.39
SLC52A2-208ENST00000527078 GLI2P10070 1586 aa36.21■■■■□ 3.39
SLC52A2-208ENST00000527078 DAPK1P53355 1430 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC52A2-208ENST00000527078 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.2■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.19■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.385e-6■■□□□ 11.8
SLC52A2-208ENST00000527078 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.17■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.17■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 FANCAO15360 1455 aa36.17■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 MBD5Q9P267 1494 aa36.17■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.15■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.15■■■■□ 3.38
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCC1P33527 1531 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC52A2-208ENST00000527078 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC52A2-208ENST00000527078 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC52A2-208ENST00000527078 TSPOAP1O95153 1857 aa36.07■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 AKNAQ7Z591 1439 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC52A2-208ENST00000527078 ADGRL1O94910 1474 aa36.01■■■■□ 3.35
SLC52A2-208ENST00000527078 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.97■■■■□ 3.35
SLC52A2-208ENST00000527078 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC52A2-208ENST00000527078 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC52A2-208ENST00000527078 NAIPQ13075 1403 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC52A2-208ENST00000527078 HFM1A2PYH4 1435 aa35.95■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.95■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 AFAP1Q8N556 730 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 NEO1Q92859 1461 aa35.91■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 ADGRL2O95490 1459 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 ROCK1Q13464 1354 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 KDM6BO15054 1643 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 NCOA1Q15788 1441 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 TSPY4P0CV99 314 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 TSPY10P0CW01 314 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC52A2-208ENST00000527078 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC52A2-208ENST00000527078 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.81■■■■□ 3.32
SLC52A2-208ENST00000527078 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC52A2-208ENST00000527078 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SLC52A2-208ENST00000527078 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC52A2-208ENST00000527078 RAPGEF3O95398 923 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC52A2-208ENST00000527078 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC52A2-208ENST00000527078 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF15Q9NS87 1388 aa35.74■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 RICTORQ6R327 1708 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 KDM5CP41229 1560 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 PLXNC1O60486 1568 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.71■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 ATP7AQ04656 1500 aa35.7■■■■□ 3.31
SLC52A2-208ENST00000527078 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC52A2-208ENST00000527078 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
SLC52A2-208ENST00000527078 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.68■■■■□ 3.3
SLC52A2-208ENST00000527078 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.65■■■■□ 3.3
SLC52A2-208ENST00000527078 HRCP23327 699 aa35.64■■■■□ 3.3
SLC52A2-208ENST00000527078 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SLC52A2-208ENST00000527078 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
SLC52A2-208ENST00000527078 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC52A2-208ENST00000527078 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC52A2-208ENST00000527078 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC52A2-208ENST00000527078 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.56■■■■□ 3.28
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCA6Q8N139 1617 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC52A2-208ENST00000527078 TRIM52Q96A61 297 aa35.51■■■■□ 3.28
SLC52A2-208ENST00000527078 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.51■■■■□ 3.27
SLC52A2-208ENST00000527078 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC52A2-208ENST00000527078 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.47■■■■□ 3.27
SLC52A2-208ENST00000527078 ERBINQ96RT1 1412 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC52A2-208ENST00000527078 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
SLC52A2-208ENST00000527078 A2MP01023 1474 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC52A2-208ENST00000527078 PZPP20742 1482 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC52A2-208ENST00000527078 UNC13BO14795 1591 aa35.37■■■■□ 3.25
SLC52A2-208ENST00000527078 NUP155O75694 1391 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC52A2-208ENST00000527078 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC52A2-208ENST00000527078 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC52A2-208ENST00000527078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.25
SLC52A2-208ENST00000527078 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.32■■■■□ 3.24
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF3BO15066 747 aa35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms