RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.49■■■□□ 2.95
ACER3-202ENST00000525194 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.47■■■□□ 2.95
ACER3-202ENST00000525194 GLI2P10070 1586 aa33.47■■■□□ 2.95
ACER3-202ENST00000525194 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.46■■■□□ 2.95
ACER3-202ENST00000525194 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.42■■■□□ 2.94
ACER3-202ENST00000525194 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
ACER3-202ENST00000525194 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.42■■■□□ 2.94
ACER3-202ENST00000525194 CD109Q6YHK3 1445 aa33.4■■■□□ 2.94
ACER3-202ENST00000525194 DIP2BQ9P265 1576 aa33.39■■■□□ 2.94
ACER3-202ENST00000525194 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.37■■■□□ 2.93
ACER3-202ENST00000525194 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
ACER3-202ENST00000525194 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.35■■■□□ 2.93
ACER3-202ENST00000525194 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.33■■■□□ 2.93
ACER3-202ENST00000525194 ITGAEP38570 1179 aa33.32■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.32■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 FANCAO15360 1455 aa33.31■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.3■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.29■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.29■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.26■■■□□ 2.91
ACER3-202ENST00000525194 DAPK1P53355 1430 aa33.25■■■□□ 2.91
ACER3-202ENST00000525194 ABCC1P33527 1531 aa33.22■■■□□ 2.91
ACER3-202ENST00000525194 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.21■■■□□ 2.91
ACER3-202ENST00000525194 ABCC5O15440 1437 aa33.21■■■□□ 2.91
ACER3-202ENST00000525194 NEO1Q92859 1461 aa33.21■■■□□ 2.91
ACER3-202ENST00000525194 MBD5Q9P267 1494 aa33.19■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.19■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.19■■■□□ 2.91e-6■■■■■ 27.5
ACER3-202ENST00000525194 AKNAQ7Z591 1439 aa33.19■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.18■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.17■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 ADGRL1O94910 1474 aa33.16■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.15■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 TSPY4P0CV99 314 aa33.15■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 TSPY10P0CW01 314 aa33.15■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 PTPRKQ15262 1439 aa33.15■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.15■■■□□ 2.9
ACER3-202ENST00000525194 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.11■■■□□ 2.89
ACER3-202ENST00000525194 ROCK1Q13464 1354 aa33.1■■■□□ 2.89
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.1■■■□□ 2.89
ACER3-202ENST00000525194 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.07■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.06■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.06■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 TSPOAP1O95153 1857 aa33.05■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 ADGRL2O95490 1459 aa33.05■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.04■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 HFM1A2PYH4 1435 aa33.04■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.04■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.03■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.02■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
ACER3-202ENST00000525194 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 NCOA1Q15788 1441 aa32.98■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.96■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 NAIPQ13075 1403 aa32.96■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.96■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.96■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.95■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 HRCP23327 699 aa32.95■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 AFAP1Q8N556 730 aa32.95■■■□□ 2.87
ACER3-202ENST00000525194 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
ACER3-202ENST00000525194 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.91■■■□□ 2.86
ACER3-202ENST00000525194 PLXNC1O60486 1568 aa32.9■■■□□ 2.86
ACER3-202ENST00000525194 KDM5CP41229 1560 aa32.89■■■□□ 2.86
ACER3-202ENST00000525194 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 KIF15Q9NS87 1388 aa32.86■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 ATP7AQ04656 1500 aa32.86■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.86■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 RICTORQ6R327 1708 aa32.85■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.84■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.84■■■□□ 2.85
ACER3-202ENST00000525194 RAPGEF3O95398 923 aa32.81■■■□□ 2.84
ACER3-202ENST00000525194 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.81■■■□□ 2.84
ACER3-202ENST00000525194 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.79■■■□□ 2.84
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.78■■■□□ 2.84
ACER3-202ENST00000525194 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.76■■■□□ 2.83
ACER3-202ENST00000525194 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.75■■■□□ 2.83
ACER3-202ENST00000525194 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.75■■■□□ 2.83
ACER3-202ENST00000525194 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.74■■■□□ 2.83
ACER3-202ENST00000525194 ERBINQ96RT1 1412 aa32.71■■■□□ 2.83
ACER3-202ENST00000525194 KDM6BO15054 1643 aa32.69■■■□□ 2.82
ACER3-202ENST00000525194 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ACER3-202ENST00000525194 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
ACER3-202ENST00000525194 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ACER3-202ENST00000525194 TRIM52Q96A61 297 aa32.63■■■□□ 2.81
ACER3-202ENST00000525194 A2MP01023 1474 aa32.62■■■□□ 2.81
ACER3-202ENST00000525194 ABCA6Q8N139 1617 aa32.62■■■□□ 2.81
ACER3-202ENST00000525194 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.6■■■□□ 2.81
ACER3-202ENST00000525194 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
ACER3-202ENST00000525194 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
ACER3-202ENST00000525194 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.56■■■□□ 2.8
ACER3-202ENST00000525194 ATP10AO60312 1499 aa32.54■■■□□ 2.8
ACER3-202ENST00000525194 UNC13BO14795 1591 aa32.53■■■□□ 2.8
ACER3-202ENST00000525194 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.51■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.5■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms