RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 PREX2Q70Z35 1606 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-205ENST00000520166 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-205ENST00000520166 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-205ENST00000520166 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-205ENST00000520166 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.83■■□□□ 1.73
TSNARE1-205ENST00000520166 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1-205ENST00000520166 PTPRKQ15262 1439 aa25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1-205ENST00000520166 CD109Q6YHK3 1445 aa25.81■■□□□ 1.72
TSNARE1-205ENST00000520166 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.726e-7■■■■□ 23.7
TSNARE1-205ENST00000520166 DIP2BQ9P265 1576 aa25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1-205ENST00000520166 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.79■■□□□ 1.72
TSNARE1-205ENST00000520166 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.721e-9■■■■□ 23.3
TSNARE1-205ENST00000520166 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.77■■□□□ 1.72
TSNARE1-205ENST00000520166 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.75■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 GLI2P10070 1586 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.73■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 FANCAO15360 1455 aa25.72■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 ABCC5O15440 1437 aa25.72■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.71■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.71■■□□□ 1.71
TSNARE1-205ENST00000520166 MBD5Q9P267 1494 aa25.7■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 DAPK1P53355 1430 aa25.69■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.68■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.68■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 TSPOAP1O95153 1857 aa25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 AKNAQ7Z591 1439 aa25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.64■■□□□ 1.7
TSNARE1-205ENST00000520166 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 AFAP1Q8N556 730 aa25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 ABCC1P33527 1531 aa25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.61■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.61■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 ADGRL1O94910 1474 aa25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1-205ENST00000520166 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 RAPGEF3O95398 923 aa25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 TSPY4P0CV99 314 aa25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 TSPY10P0CW01 314 aa25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.53■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 NEO1Q92859 1461 aa25.53■■□□□ 1.68
TSNARE1-205ENST00000520166 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 NAIPQ13075 1403 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 NCOA1Q15788 1441 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 KDM6BO15054 1643 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 HFM1A2PYH4 1435 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 ROCK1Q13464 1354 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-205ENST00000520166 ADGRL2O95490 1459 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-205ENST00000520166 KIF15Q9NS87 1388 aa25.39■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.37■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 RICTORQ6R327 1708 aa25.37■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 KDM5CP41229 1560 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 ATP7AQ04656 1500 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-205ENST00000520166 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-205ENST00000520166 PLXNC1O60486 1568 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-205ENST00000520166 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-205ENST00000520166 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-205ENST00000520166 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-205ENST00000520166 HRCP23327 699 aa25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1-205ENST00000520166 TRIM52Q96A61 297 aa25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1-205ENST00000520166 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1-205ENST00000520166 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1-205ENST00000520166 ABCA6Q8N139 1617 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-205ENST00000520166 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1-205ENST00000520166 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 A2MP01023 1474 aa25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 KIF3BO15066 747 aa25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 ERBINQ96RT1 1412 aa25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1-205ENST00000520166 FOXD1Q16676 465 aa25.14■■□□□ 1.61
TSNARE1-205ENST00000520166 NUP155O75694 1391 aa25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1-205ENST00000520166 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1-205ENST00000520166 PZPP20742 1482 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-205ENST00000520166 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-205ENST00000520166 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.09■■□□□ 1.61
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