RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518720.5

TSNARE1-202, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-202ENST00000518720 PLCH2O75038 1416 aa26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1-202ENST00000518720 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1-202ENST00000518720 FANCAO15360 1455 aa26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1-202ENST00000518720 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.55■■□□□ 1.84
TSNARE1-202ENST00000518720 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1-202ENST00000518720 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 NEO1Q92859 1461 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 AKNAQ7Z591 1439 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 ABCC1P33527 1531 aa26.45■■□□□ 1.83
TSNARE1-202ENST00000518720 ADGRL1O94910 1474 aa26.45■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.45■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 KDM6BO15054 1643 aa26.43■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 MIA2Q96PC5 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-202ENST00000518720 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.38■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 RICTORQ6R327 1708 aa26.36■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TSNARE1-202ENST00000518720 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.32■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.85e-6■■■■□ 20.3
TSNARE1-202ENST00000518720 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 RAPGEF3O95398 923 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-202ENST00000518720 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-202ENST00000518720 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-202ENST00000518720 MBD5Q9P267 1494 aa26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-202ENST00000518720 KDM5CP41229 1560 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-202ENST00000518720 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-202ENST00000518720 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-202ENST00000518720 AFAP1Q8N556 730 aa26.2■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 DAPK1P53355 1430 aa26.19■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.15■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 ABCC5O15440 1437 aa26.15■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 ATP7AQ04656 1500 aa26.15■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.781e-9■■■□□ 18.2
TSNARE1-202ENST00000518720 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.14■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.14■■□□□ 1.78
TSNARE1-202ENST00000518720 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 ITGAEP38570 1179 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 ABCA6Q8N139 1617 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.11■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.1■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 TSPY4P0CV99 314 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 TSPY10P0CW01 314 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1-202ENST00000518720 PLXNC1O60486 1568 aa26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1-202ENST00000518720 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1-202ENST00000518720 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1-202ENST00000518720 PTPRKQ15262 1439 aa26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1-202ENST00000518720 ADGRL2O95490 1459 aa25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1-202ENST00000518720 ATP10AO60312 1499 aa25.98■■□□□ 1.75
TSNARE1-202ENST00000518720 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1-202ENST00000518720 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF15Q9NS87 1388 aa25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 A2MP01023 1474 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 REREQ9P2R6 1566 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 NCOA1Q15788 1441 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 ROCK1Q13464 1354 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-202ENST00000518720 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-202ENST00000518720 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-202ENST00000518720 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-202ENST00000518720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-202ENST00000518720 ERBINQ96RT1 1412 aa25.83■■□□□ 1.73
TSNARE1-202ENST00000518720 AGLP35573 1532 aa25.83■■□□□ 1.72
TSNARE1-202ENST00000518720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1-202ENST00000518720 HFM1A2PYH4 1435 aa25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1-202ENST00000518720 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1-202ENST00000518720 NAIPQ13075 1403 aa25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1-202ENST00000518720 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF3BO15066 747 aa25.76■■□□□ 1.71
TSNARE1-202ENST00000518720 MLECQ14165 292 aa25.75■■□□□ 1.71
TSNARE1-202ENST00000518720 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.73■■□□□ 1.71
TSNARE1-202ENST00000518720 DEPDC5O75140 1603 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms