RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PFKL-211ENST00000498841 SYNJ2O15056 1496 aa23.48■■□□□ 1.35
PFKL-211ENST00000498841 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.44■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.44■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.44■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 ARHGEF11O15085 1522 aa23.43■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.42■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.42■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 DAPK1P53355 1430 aa23.4■■□□□ 1.34
PFKL-211ENST00000498841 ABCC5O15440 1437 aa23.38■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 15.2
PFKL-211ENST00000498841 KIF14Q15058 1648 aa23.36■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 ANP32CO43423 234 aa23.36■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 MIA2Q96PC5 1412 aa23.35■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 FKBP8Q14318 412 aa23.35■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.35■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PFKL-211ENST00000498841 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.29■■□□□ 1.32
PFKL-211ENST00000498841 PTPRGP23470 1445 aa23.28■■□□□ 1.32
PFKL-211ENST00000498841 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.27■■□□□ 1.32
PFKL-211ENST00000498841 NUP160Q12769 1436 aa23.27■■□□□ 1.32
PFKL-211ENST00000498841 PKD2Q13563 968 aa23.27■■□□□ 1.32
PFKL-211ENST00000498841 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.311e-7■□□□□ 10
PFKL-211ENST00000498841 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.25■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.23■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 ATP10BO94823 1461 aa23.23■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.22■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 TSPY4P0CV99 314 aa23.22■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 TSPY10P0CW01 314 aa23.22■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PFKL-211ENST00000498841 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.2■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 AKNAQ7Z591 1439 aa23.17■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 NUP155O75694 1391 aa23.16■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 NCOA1Q15788 1441 aa23.16■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.15■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.15■■□□□ 1.3
PFKL-211ENST00000498841 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.13■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.12■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 RGL3Q3MIN7 710 aa23.11■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 ROCK1Q13464 1354 aa23.11■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 CHD1O14646 1710 aa23.11■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 NEFLP07196 543 aa23.11■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.1■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 CCDC184Q52MB2 194 aa23.1■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
PFKL-211ENST00000498841 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.08■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.07■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.06■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 ABCA8O94911 1581 aa23.06■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 PZPP20742 1482 aa23.05■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 KIF15Q9NS87 1388 aa23.05■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.04■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.03■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.02■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PFKL-211ENST00000498841 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.99■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.96■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 CCER2I3L3R5 266 aa22.96■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.96■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.96■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.96■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 MSH5O43196 834 aa22.95■■□□□ 1.27
PFKL-211ENST00000498841 MRS2Q9HD23 443 aa22.94■■□□□ 1.26
PFKL-211ENST00000498841 CCDC7Q96M83 1385 aa22.94■■□□□ 1.26
PFKL-211ENST00000498841 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.94■■□□□ 1.26
PFKL-211ENST00000498841 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.9■■□□□ 1.26
PFKL-211ENST00000498841 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.9■■□□□ 1.26
PFKL-211ENST00000498841 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.9■■□□□ 1.26
PFKL-211ENST00000498841 USP47Q96K76 1375 aa22.89■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 AFAP1Q8N556 730 aa22.88■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.88■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.86■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.85■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.85■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 ADGRL2O95490 1459 aa22.85■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 MBD5Q9P267 1494 aa22.84■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.83■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.83■■□□□ 1.25
PFKL-211ENST00000498841 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.8■■□□□ 1.24
PFKL-211ENST00000498841 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.242e-6■■□□□ 12.3
PFKL-211ENST00000498841 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
PFKL-211ENST00000498841 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PFKL-211ENST00000498841 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.78■■□□□ 1.24
PFKL-211ENST00000498841 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PFKL-211ENST00000498841 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.77■■□□□ 1.24
PFKL-211ENST00000498841 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 ABCC2Q92887 1545 aa22.75■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 PREX2Q70Z35 1606 aa22.73■■□□□ 1.23
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