RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483868.5

TPRA1-208, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, human

TSL 5

Gene TPRA1, Length 1,720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRA1-208	ENST00000483868	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		42.59	■■■■■ 4.41
TPRA1-208	ENST00000483868	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.58	■■■■■ 4.41
TPRA1-208	ENST00000483868	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
TPRA1-208	ENST00000483868	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.54	■■■■■ 4.4
TPRA1-208	ENST00000483868	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
TPRA1-208	ENST00000483868	FANCA	O15360	1455 aa		42.53	■■■■■ 4.4
TPRA1-208	ENST00000483868	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.53	■■■■■ 4.4
TPRA1-208	ENST00000483868	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.51	■■■■■ 4.4
TPRA1-208	ENST00000483868	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.48	■■■■■ 4.39
TPRA1-208	ENST00000483868	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.44	■■■■■ 4.38
TPRA1-208	ENST00000483868	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.42	■■■■■ 4.38
TPRA1-208	ENST00000483868	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.42	■■■■■ 4.38
TPRA1-208	ENST00000483868	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.41	■■■■■ 4.38
TPRA1-208	ENST00000483868	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.39	■■■■■ 4.38
TPRA1-208	ENST00000483868	NEO1	Q92859	1461 aa		42.39	■■■■■ 4.38
TPRA1-208	ENST00000483868	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.34	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.34	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.32	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.32	■■■■■ 4.37
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCC1	P33527	1531 aa		42.31	■■■■■ 4.36
TPRA1-208	ENST00000483868	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.29	■■■■■ 4.36
TPRA1-208	ENST00000483868	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.29	■■■■■ 4.36
TPRA1-208	ENST00000483868	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.25	■■■■■ 4.35
TPRA1-208	ENST00000483868	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.24	■■■■■ 4.35
TPRA1-208	ENST00000483868	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
TPRA1-208	ENST00000483868	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.23	■■■■■ 4.35
TPRA1-208	ENST00000483868	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.21	■■■■■ 4.35
TPRA1-208	ENST00000483868	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.19	■■■■■ 4.34
TPRA1-208	ENST00000483868	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.17	■■■■■ 4.34	2e-6	■■■□□ 17.8
TPRA1-208	ENST00000483868	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.17	■■■■■ 4.34
TPRA1-208	ENST00000483868	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.15	■■■■■ 4.34
TPRA1-208	ENST00000483868	ITGAE	P38570	1179 aa		42.12	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.11	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCC5	O15440	1437 aa		42.11	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.1	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	DAPK1	P53355	1430 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.07	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.07	■■■■■ 4.33
TPRA1-208	ENST00000483868	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.06	■■■■■ 4.32
TPRA1-208	ENST00000483868	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.05	■■■■■ 4.32
TPRA1-208	ENST00000483868	KDM6B	O15054	1643 aa		42.03	■■■■■ 4.32
TPRA1-208	ENST00000483868	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.03	■■■■■ 4.32
TPRA1-208	ENST00000483868	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42	■■■■■ 4.31
TPRA1-208	ENST00000483868	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.98	■■■■■ 4.31
TPRA1-208	ENST00000483868	KDM5C	P41229	1560 aa		41.98	■■■■■ 4.31
TPRA1-208	ENST00000483868	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.97	■■■■■ 4.31
TPRA1-208	ENST00000483868	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.95	■■■■■ 4.31
TPRA1-208	ENST00000483868	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.95	■■■■■ 4.31
TPRA1-208	ENST00000483868	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
TPRA1-208	ENST00000483868	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.93	■■■■■ 4.3
TPRA1-208	ENST00000483868	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.89	■■■■■ 4.3
TPRA1-208	ENST00000483868	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.87	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.86	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.86	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		41.86	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.85	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.84	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	ATP7A	Q04656	1500 aa		41.84	■■■■■ 4.29
TPRA1-208	ENST00000483868	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.82	■■■■■ 4.28
TPRA1-208	ENST00000483868	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.81	■■■■■ 4.28
TPRA1-208	ENST00000483868	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TPRA1-208	ENST00000483868	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TPRA1-208	ENST00000483868	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.76	■■■■■ 4.28
TPRA1-208	ENST00000483868	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.74	■■■■■ 4.27
TPRA1-208	ENST00000483868	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.73	■■■■■ 4.27
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.73	■■■■■ 4.27
TPRA1-208	ENST00000483868	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.73	■■■■■ 4.27
TPRA1-208	ENST00000483868	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.71	■■■■■ 4.27
TPRA1-208	ENST00000483868	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		41.71	■■■■■ 4.27
TPRA1-208	ENST00000483868	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.69	■■■■■ 4.26
TPRA1-208	ENST00000483868	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.68	■■■■■ 4.26
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.68	■■■■■ 4.26
TPRA1-208	ENST00000483868	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TPRA1-208	ENST00000483868	NAIP	Q13075	1403 aa		41.6	■■■■■ 4.25
TPRA1-208	ENST00000483868	ATP10A	O60312	1499 aa		41.58	■■■■■ 4.25
TPRA1-208	ENST00000483868	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.58	■■■■■ 4.25
TPRA1-208	ENST00000483868	A2M	P01023	1474 aa		41.56	■■■■■ 4.24
TPRA1-208	ENST00000483868	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.54	■■■■■ 4.24
TPRA1-208	ENST00000483868	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.53	■■■■■ 4.24
TPRA1-208	ENST00000483868	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.52	■■■■■ 4.24
TPRA1-208	ENST00000483868	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TPRA1-208	ENST00000483868	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TPRA1-208	ENST00000483868	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		41.44	■■■■■ 4.22
TPRA1-208	ENST00000483868	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.43	■■■■■ 4.22
TPRA1-208	ENST00000483868	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.43	■■■■■ 4.22
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF3B	O15066	747 aa		41.38	■■■■■ 4.22
TPRA1-208	ENST00000483868	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		41.38	■■■■■ 4.21
TPRA1-208	ENST00000483868	AGL	P35573	1532 aa		41.32	■■■■■ 4.21
TPRA1-208	ENST00000483868	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.32	■■■■■ 4.21
TPRA1-208	ENST00000483868	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.31	■■■■■ 4.2
TPRA1-208	ENST00000483868	GGT6	Q6P531	493 aa		41.27	■■■■■ 4.2
TPRA1-208	ENST00000483868	MLEC	Q14165	292 aa		41.26	■■■■■ 4.2
TPRA1-208	ENST00000483868	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.26	■■■■■ 4.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.9 ms