RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.03■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.02■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 NEO1Q92859 1461 aa31.01■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
ACTB-210ENST00000477812 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.99■■■□□ 2.55
ACTB-210ENST00000477812 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.99■■■□□ 2.55
ACTB-210ENST00000477812 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.95■■■□□ 2.55
ACTB-210ENST00000477812 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
ACTB-210ENST00000477812 AKNAQ7Z591 1439 aa30.92■■■□□ 2.54
ACTB-210ENST00000477812 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
ACTB-210ENST00000477812 MIA2Q96PC5 1412 aa30.91■■■□□ 2.54
ACTB-210ENST00000477812 ABCC1P33527 1531 aa30.88■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.88■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 ADGRL1O94910 1474 aa30.87■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.83■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.83■■■□□ 2.53
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.82■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.81■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.81■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 KDM6BO15054 1643 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.79■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 MBD5Q9P267 1494 aa30.77■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.77■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 RICTORQ6R327 1708 aa30.76■■■□□ 2.52
ACTB-210ENST00000477812 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
ACTB-210ENST00000477812 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.73■■■□□ 2.51
ACTB-210ENST00000477812 KDM5CP41229 1560 aa30.71■■■□□ 2.51
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.71■■■□□ 2.51
ACTB-210ENST00000477812 RAPGEF3O95398 923 aa30.7■■■□□ 2.51
ACTB-210ENST00000477812 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.7■■■□□ 2.5
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.53e-29■□□□□ 9.6
ACTB-210ENST00000477812 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.68■■■□□ 2.5
ACTB-210ENST00000477812 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.54e-28■■□□□ 12.2
ACTB-210ENST00000477812 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.64■■■□□ 2.5
ACTB-210ENST00000477812 AFAP1Q8N556 730 aa30.63■■■□□ 2.49
ACTB-210ENST00000477812 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
ACTB-210ENST00000477812 ABCC5O15440 1437 aa30.59■■■□□ 2.49
ACTB-210ENST00000477812 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
ACTB-210ENST00000477812 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.58■■■□□ 2.49
ACTB-210ENST00000477812 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.57■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 DAPK1P53355 1430 aa30.57■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.57■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.57■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.56■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.55■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.55■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.54■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.52■■■□□ 2.48
ACTB-210ENST00000477812 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.51■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 ATP7AQ04656 1500 aa30.51■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.51■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.5■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 PTPRKQ15262 1439 aa30.49■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.49■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 ABCA6Q8N139 1617 aa30.47■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.45■■■□□ 2.47
ACTB-210ENST00000477812 TSPY4P0CV99 314 aa30.43■■■□□ 2.46
ACTB-210ENST00000477812 TSPY10P0CW01 314 aa30.43■■■□□ 2.46
ACTB-210ENST00000477812 PLXNC1O60486 1568 aa30.41■■■□□ 2.46
ACTB-210ENST00000477812 ADGRL2O95490 1459 aa30.41■■■□□ 2.46
ACTB-210ENST00000477812 REREQ9P2R6 1566 aa30.37■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.37■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 ATP10AO60312 1499 aa30.37■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 NCOA1Q15788 1441 aa30.35■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 ROCK1Q13464 1354 aa30.34■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 ITGAEP38570 1179 aa30.33■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.33■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.33■■■□□ 2.45
ACTB-210ENST00000477812 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.32■■■□□ 2.44
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.31■■■□□ 2.44
ACTB-210ENST00000477812 A2MP01023 1474 aa30.3■■■□□ 2.44
ACTB-210ENST00000477812 KIF15Q9NS87 1388 aa30.28■■■□□ 2.44
ACTB-210ENST00000477812 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.26■■■□□ 2.43
ACTB-210ENST00000477812 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
ACTB-210ENST00000477812 AGLP35573 1532 aa30.25■■■□□ 2.43
ACTB-210ENST00000477812 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.23■■■□□ 2.43
ACTB-210ENST00000477812 ERBINQ96RT1 1412 aa30.19■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.19■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 HFM1A2PYH4 1435 aa30.18■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 NAIPQ13075 1403 aa30.17■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.16■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.14■■■□□ 2.42
ACTB-210ENST00000477812 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ACTB-210ENST00000477812 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.07■■■□□ 2.4
ACTB-210ENST00000477812 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ACTB-210ENST00000477812 DEPDC5O75140 1603 aa30.06■■■□□ 2.4
ACTB-210ENST00000477812 KIF3BO15066 747 aa30.05■■■□□ 2.4
ACTB-210ENST00000477812 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
ACTB-210ENST00000477812 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.01■■■□□ 2.4
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