RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.49■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.48■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.48■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 NCOA2Q15596 1464 aa26.48■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 AKNAQ7Z591 1439 aa26.48■■□□□ 1.83
USP39-211ENST00000465282 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
USP39-211ENST00000465282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
USP39-211ENST00000465282 ADGRL1O94910 1474 aa26.39■■□□□ 1.82
USP39-211ENST00000465282 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
USP39-211ENST00000465282 RICTORQ6R327 1708 aa26.35■■□□□ 1.81
USP39-211ENST00000465282 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.35■■□□□ 1.81
USP39-211ENST00000465282 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.35■■□□□ 1.81
USP39-211ENST00000465282 ABCC1P33527 1531 aa26.33■■□□□ 1.81
USP39-211ENST00000465282 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.33■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.31■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.31■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.3■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 RAPGEF3O95398 923 aa26.3■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.3■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 MIA2Q96PC5 1412 aa26.3■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.29■■□□□ 1.8
USP39-211ENST00000465282 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.26■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.24■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.24■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.23■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 KDM5CP41229 1560 aa26.22■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.21■■□□□ 1.79
USP39-211ENST00000465282 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.2■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.19■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 AFAP1Q8N556 730 aa26.18■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.17■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 MBD5Q9P267 1494 aa26.17■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.16■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.16■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.15■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.15■■□□□ 1.78
USP39-211ENST00000465282 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.14■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.14■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.11■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.08■■□□□ 1.77
USP39-211ENST00000465282 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.06■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.06■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.05■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 ATP10AO60312 1499 aa26.04■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 ATP7AQ04656 1500 aa26.04■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 TSPY4P0CV99 314 aa26.04■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 TSPY10P0CW01 314 aa26.04■■□□□ 1.76
USP39-211ENST00000465282 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 ABCA6Q8N139 1617 aa26.01■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 REREQ9P2R6 1566 aa26.01■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.01■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.751e-6■□□□□ 11
USP39-211ENST00000465282 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.98■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.97■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.97■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 ABCC5O15440 1437 aa25.96■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 DAPK1P53355 1430 aa25.96■■□□□ 1.75
USP39-211ENST00000465282 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USP39-211ENST00000465282 AGLP35573 1532 aa25.91■■□□□ 1.74
USP39-211ENST00000465282 PLXNC1O60486 1568 aa25.9■■□□□ 1.74
USP39-211ENST00000465282 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
USP39-211ENST00000465282 A2MP01023 1474 aa25.89■■□□□ 1.73
USP39-211ENST00000465282 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.88■■□□□ 1.73
USP39-211ENST00000465282 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.88■■□□□ 1.73
USP39-211ENST00000465282 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
USP39-211ENST00000465282 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.82■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 ADGRL2O95490 1459 aa25.82■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.81■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.8■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 NCOA1Q15788 1441 aa25.8■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.78■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 KIF15Q9NS87 1388 aa25.77■■□□□ 1.72
USP39-211ENST00000465282 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.76■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 ROCK1Q13464 1354 aa25.76■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 PTPRKQ15262 1439 aa25.74■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.74■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.73■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 ERBINQ96RT1 1412 aa25.72■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.72■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 MLECQ14165 292 aa25.71■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 MADDQ8WXG6 1647 aa25.7■■□□□ 1.71
USP39-211ENST00000465282 ITGAEP38570 1179 aa25.7■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 KIF3BO15066 747 aa25.69■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.67■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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