RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 ASXL2Q76L83 1435 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC1-211ENST00000460558 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCC2Q92887 1545 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.57□□□□□ -1.2
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ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHG5O94827 1062 aa7.54□□□□□ -1.2
ECHDC1-211ENST00000460558 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ECHDC1-211ENST00000460558 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC1-211ENST00000460558 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
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ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.51□□□□□ -1.21
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ECHDC1-211ENST00000460558 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.49□□□□□ -1.21
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ECHDC1-211ENST00000460558 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC1-211ENST00000460558 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC1-211ENST00000460558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.46□□□□□ -1.21
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ECHDC1-211ENST00000460558 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.45□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.44□□□□□ -1.22
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ECHDC1-211ENST00000460558 CD109Q6YHK3 1445 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 UACAQ9BZF9 1416 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 CREBZFQ9NS37 354 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 STRCQ7RTU9 1775 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC1-211ENST00000460558 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.4□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.39□□□□□ -1.23
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM212AQ96EL1 285 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.35□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.35□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.35□□□□□ -1.23
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ECHDC1-211ENST00000460558 RASEFQ8IZ41 740 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNH8Q96L42 1107 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRTO14522 1441 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC1-211ENST00000460558 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.33□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 FANCAO15360 1455 aa7.33□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 DISP1Q96F81 1524 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPGEF3O95398 923 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 PITPNM1O00562 1244 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0556O60303 1618 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 NEO1Q92859 1461 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 RICTORQ6R327 1708 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 AKNAQ7Z591 1439 aa7.27□□□□□ -1.24
ECHDC1-211ENST00000460558 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.27□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 STK25O00506 426 aa7.27□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 IGF1RP08069 1367 aa7.27□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.27□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCA8O94911 1581 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF27Q86VH2 1401 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPA1LP34931 641 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 MLECQ14165 292 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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