RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449692.3

C11orf68-202, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C11orf68, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-202ENST00000449692 CCNB3Q8WWL7 1395 aa47.28■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 KDM6BO15054 1643 aa47.26■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.25■■■■■ 5.15
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.25■■■■■ 5.15
C11orf68-202ENST00000449692 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.24■■■■■ 5.15
C11orf68-202ENST00000449692 AKNAQ7Z591 1439 aa47.23■■■■■ 5.15
C11orf68-202ENST00000449692 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
C11orf68-202ENST00000449692 ITSN2Q9NZM3 1697 aa47.11■■■■■ 5.13
C11orf68-202ENST00000449692 ADGRL1O94910 1474 aa47.08■■■■■ 5.13
C11orf68-202ENST00000449692 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
C11orf68-202ENST00000449692 SCAPERQ9BY12 1400 aa47.03■■■■■ 5.12
C11orf68-202ENST00000449692 RAPGEF3O95398 923 aa47.01■■■■■ 5.12
C11orf68-202ENST00000449692 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.11
C11orf68-202ENST00000449692 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa47■■■■■ 5.11
C11orf68-202ENST00000449692 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
C11orf68-202ENST00000449692 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.98■■■■■ 5.11
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC1P33527 1531 aa46.96■■■■■ 5.11
C11orf68-202ENST00000449692 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.94■■■■■ 5.11
C11orf68-202ENST00000449692 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.93■■■■■ 5.1
C11orf68-202ENST00000449692 RICTORQ6R327 1708 aa46.92■■■■■ 5.1
C11orf68-202ENST00000449692 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.9■■■■■ 5.1
C11orf68-202ENST00000449692 MIA2Q96PC5 1412 aa46.88■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.87■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.86■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.84■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.82■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.82■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.82■■■■■ 5.09
C11orf68-202ENST00000449692 AFAP1Q8N556 730 aa46.81■■■■■ 5.08
C11orf68-202ENST00000449692 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.8■■■■■ 5.08
C11orf68-202ENST00000449692 FGD6Q6ZV73 1430 aa46.78■■■■■ 5.08
C11orf68-202ENST00000449692 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.75■■■■■ 5.08
C11orf68-202ENST00000449692 MBD5Q9P267 1494 aa46.74■■■■■ 5.07
C11orf68-202ENST00000449692 KDM5CP41229 1560 aa46.73■■■■■ 5.07
C11orf68-202ENST00000449692 PTPN23Q9H3S7 1636 aa46.7■■■■■ 5.07
C11orf68-202ENST00000449692 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
C11orf68-202ENST00000449692 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.64■■■■■ 5.06
C11orf68-202ENST00000449692 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.59■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.59■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.58■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.58■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.57■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.57■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.57■■■■■ 5.05
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.55■■■■■ 5.04
C11orf68-202ENST00000449692 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
C11orf68-202ENST00000449692 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.51■■■■■ 5.04
C11orf68-202ENST00000449692 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.5■■■■■ 5.03
C11orf68-202ENST00000449692 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
C11orf68-202ENST00000449692 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
C11orf68-202ENST00000449692 ATP7AQ04656 1500 aa46.44■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC5O15440 1437 aa46.41■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA6Q8N139 1617 aa46.41■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 TSPY4P0CV99 314 aa46.41■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 TSPY10P0CW01 314 aa46.41■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.4■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.4■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 ATP10AO60312 1499 aa46.39■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
C11orf68-202ENST00000449692 DAPK1P53355 1430 aa46.38■■■■■ 5.01
C11orf68-202ENST00000449692 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.012e-8■■■■■ 65.9
C11orf68-202ENST00000449692 MAST1Q9Y2H9 1570 aa46.33■■■■■ 5.01
C11orf68-202ENST00000449692 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.32■■■■■ 5.01
C11orf68-202ENST00000449692 CROCC2H7BZ55 1655 aa46.31■■■■■ 5
C11orf68-202ENST00000449692 SHANK2Q9UPX8 1470 aa46.29■■■■■ 5
C11orf68-202ENST00000449692 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.28■■■■■ 5
C11orf68-202ENST00000449692 REREQ9P2R6 1566 aa46.25■■■■■ 4.99
C11orf68-202ENST00000449692 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.99
C11orf68-202ENST00000449692 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.18■■■■■ 4.98
C11orf68-202ENST00000449692 A2MP01023 1474 aa46.18■■■■■ 4.98
C11orf68-202ENST00000449692 PTPRKQ15262 1439 aa46.17■■■■■ 4.98
C11orf68-202ENST00000449692 CHIC2Q9UKJ5 165 aa46.17■■■■■ 4.98
C11orf68-202ENST00000449692 PLXNC1O60486 1568 aa46.14■■■■■ 4.98
C11orf68-202ENST00000449692 AGLP35573 1532 aa46.1■■■■■ 4.97
C11orf68-202ENST00000449692 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
C11orf68-202ENST00000449692 ITGAEP38570 1179 aa46.09■■■■■ 4.97
C11orf68-202ENST00000449692 ADGRL2O95490 1459 aa46.07■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa46.06■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 NCOA1Q15788 1441 aa46.06■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa46.05■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.04■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 KIF15Q9NS87 1388 aa46.04■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.02■■■■■ 4.96
C11orf68-202ENST00000449692 MLECQ14165 292 aa45.99■■■■■ 4.95
C11orf68-202ENST00000449692 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.98■■■■■ 4.95
C11orf68-202ENST00000449692 ROCK1Q13464 1354 aa45.95■■■■■ 4.95
C11orf68-202ENST00000449692 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.94■■■■■ 4.95
C11orf68-202ENST00000449692 KIF3BO15066 747 aa45.88■■■■■ 4.94
C11orf68-202ENST00000449692 ERBINQ96RT1 1412 aa45.85■■■■■ 4.93
C11orf68-202ENST00000449692 MADDQ8WXG6 1647 aa45.83■■■■■ 4.93
C11orf68-202ENST00000449692 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
C11orf68-202ENST00000449692 GGT6Q6P531 493 aa45.81■■■■■ 4.92
C11orf68-202ENST00000449692 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa45.76■■■■■ 4.92
C11orf68-202ENST00000449692 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.76■■■■■ 4.92
C11orf68-202ENST00000449692 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
C11orf68-202ENST00000449692 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
C11orf68-202ENST00000449692 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.68■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms