RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-208ENST00000434353 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.27■■■□□ 2.28
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CXorf40A-208ENST00000434353 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.22■■■□□ 2.27
CXorf40A-208ENST00000434353 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CXorf40A-208ENST00000434353 NEO1Q92859 1461 aa29.2■■■□□ 2.27
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CXorf40A-208ENST00000434353 ITGAEP38570 1179 aa28.76■■■□□ 2.19
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CXorf40A-208ENST00000434353 KIF15Q9NS87 1388 aa28.56■■■□□ 2.16
CXorf40A-208ENST00000434353 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.55■■■□□ 2.16
CXorf40A-208ENST00000434353 REREQ9P2R6 1566 aa28.54■■■□□ 2.16
CXorf40A-208ENST00000434353 ROCK1Q13464 1354 aa28.54■■■□□ 2.16
CXorf40A-208ENST00000434353 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
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CXorf40A-208ENST00000434353 AGLP35573 1532 aa28.46■■■□□ 2.15
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CXorf40A-208ENST00000434353 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.42■■■□□ 2.14
CXorf40A-208ENST00000434353 KIF3BO15066 747 aa28.41■■■□□ 2.14
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CXorf40A-208ENST00000434353 HFM1A2PYH4 1435 aa28.4■■■□□ 2.14
CXorf40A-208ENST00000434353 NAIPQ13075 1403 aa28.4■■■□□ 2.14
CXorf40A-208ENST00000434353 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.4■■■□□ 2.14
CXorf40A-208ENST00000434353 MLECQ14165 292 aa28.4■■■□□ 2.14
CXorf40A-208ENST00000434353 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.36■■■□□ 2.13
CXorf40A-208ENST00000434353 GGT6Q6P531 493 aa28.35■■■□□ 2.13
CXorf40A-208ENST00000434353 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CXorf40A-208ENST00000434353 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.27■■■□□ 2.12
CXorf40A-208ENST00000434353 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
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