RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 IFT140Q96RY7 1462 aa27.39■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.39■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.38■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 PKD2Q13563 968 aa27.37■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC184Q52MB2 194 aa27.37■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTS12P58397 1594 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 KDM6BO15054 1643 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 PBRM1Q86U86 1689 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 HECW1Q76N89 1606 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 GRIN2AQ12879 1464 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.31■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 RGL3Q3MIN7 710 aa27.29■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 DISP1Q96F81 1524 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 TSPY4P0CV99 314 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 TSPY10P0CW01 314 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC5O15440 1437 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 DAPK1P53355 1430 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 MRS2Q9HD23 443 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 WDR62O43379 1518 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 CCER2I3L3R5 266 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 NUP155O75694 1391 aa27.18■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 MIA2Q96PC5 1412 aa27.17■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.14■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA0556O60303 1618 aa27.14■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.11■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.11■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF11O15085 1522 aa27.09■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.08■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.08■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 SYNJ2O15056 1496 aa27.07■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.06■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRGP23470 1445 aa27.06■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 CEP170Q5SW79 1584 aa27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC7Q96M83 1385 aa27.02■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 NCOA1Q15788 1441 aa27.01■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 KIF14Q15058 1648 aa27■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 AKNAQ7Z591 1439 aa26.98■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.97■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.95■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 ATP10BO94823 1461 aa26.94■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 ROCK1Q13464 1354 aa26.93■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 KIF15Q9NS87 1388 aa26.92■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 USP47Q96K76 1375 aa26.92■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.88■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.88■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 TMC1Q8TDI8 760 aa26.86■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 PZPP20742 1482 aa26.86■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.85■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.84■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.84■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.83■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 NUP160Q12769 1436 aa26.8■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.77■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 AFAP1Q8N556 730 aa26.76■■□□□ 1.87
TTLL3-210ENST00000427220 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TTLL3-210ENST00000427220 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TTLL3-210ENST00000427220 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.66■■□□□ 1.86
TTLL3-210ENST00000427220 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.62■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.61■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.6■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.6■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.59■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.57■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 ABCA8O94911 1581 aa26.55■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.55■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.55■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 KIF3BO15066 747 aa26.54■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.54■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.52■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 PANK3Q9H999 370 aa26.51■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 MBD5Q9P267 1494 aa26.5■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRL2O95490 1459 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.48■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms