RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425718.1

APOE-202, Transcript of apolipoprotein E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOE, Length 923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOE-202ENST00000425718 NEO1Q92859 1461 aa37.31■■■■□ 3.56
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APOE-202ENST00000425718 FANCAO15360 1455 aa37.27■■■■□ 3.56
APOE-202ENST00000425718 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.27■■■■□ 3.56
APOE-202ENST00000425718 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.21■■■■□ 3.55
APOE-202ENST00000425718 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
APOE-202ENST00000425718 MIA2Q96PC5 1412 aa37.19■■■■□ 3.54
APOE-202ENST00000425718 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.15■■■■□ 3.54
APOE-202ENST00000425718 AKNAQ7Z591 1439 aa37.15■■■■□ 3.54
APOE-202ENST00000425718 ADGRL1O94910 1474 aa37.09■■■■□ 3.53
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APOE-202ENST00000425718 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.06■■■■□ 3.52
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APOE-202ENST00000425718 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.04■■■■□ 3.52
APOE-202ENST00000425718 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.04■■■■□ 3.52
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APOE-202ENST00000425718 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.94■■■■□ 3.5
APOE-202ENST00000425718 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.92■■■■□ 3.5
APOE-202ENST00000425718 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.91■■■■□ 3.5
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APOE-202ENST00000425718 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.85■■■■□ 3.49
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APOE-202ENST00000425718 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.83■■■■□ 3.49
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APOE-202ENST00000425718 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.83■■■■□ 3.49
APOE-202ENST00000425718 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.83■■■■□ 3.49
APOE-202ENST00000425718 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.48
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APOE-202ENST00000425718 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.78■■■■□ 3.48
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APOE-202ENST00000425718 TSPY4P0CV99 314 aa36.74■■■■□ 3.47
APOE-202ENST00000425718 TSPY10P0CW01 314 aa36.74■■■■□ 3.47
APOE-202ENST00000425718 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.74■■■■□ 3.47
APOE-202ENST00000425718 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.73■■■■□ 3.47
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APOE-202ENST00000425718 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.7■■■■□ 3.47
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APOE-202ENST00000425718 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
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APOE-202ENST00000425718 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.6■■■■□ 3.45
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APOE-202ENST00000425718 ABCA6Q8N139 1617 aa36.52■■■■□ 3.44
APOE-202ENST00000425718 ATP10AO60312 1499 aa36.51■■■■□ 3.44
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APOE-202ENST00000425718 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.5■■■■□ 3.43
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APOE-202ENST00000425718 ROCK1Q13464 1354 aa36.46■■■■□ 3.43
APOE-202ENST00000425718 ITGAEP38570 1179 aa36.42■■■■□ 3.42
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APOE-202ENST00000425718 A2MP01023 1474 aa36.4■■■■□ 3.42
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APOE-202ENST00000425718 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.39■■■■□ 3.42
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APOE-202ENST00000425718 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
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APOE-202ENST00000425718 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.26■■■■□ 3.4
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APOE-202ENST00000425718 DEPDC5O75140 1603 aa36.08■■■■□ 3.37
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