RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 ADAMTS12P58397 1594 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 PBRM1Q86U86 1689 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 WDR62O43379 1518 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 ANP32CO43423 234 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 AFAP1Q8N556 730 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 NUP155O75694 1391 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 ARHGEF11O15085 1522 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 DISP1Q96F81 1524 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 NBR1Q14596 966 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 NAIPQ13075 1403 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 FKBP8Q14318 412 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 CEP170Q5SW79 1584 aa11.86□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 WDR97A6NE52 1622 aa11.86□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 OSCARQ8IYS5 282 aa11.85□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 GGT6Q6P531 493 aa11.85□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ACTBP13-201ENST00000423971 HECW1Q76N89 1606 aa11.83□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 MLECQ14165 292 aa11.83□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.83□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.83□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 MAPKBP1O60336 1514 aa11.82□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.82□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF3BO15066 747 aa11.81□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.81□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 ATP10BO94823 1461 aa11.81□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 KIAA0556O60303 1618 aa11.81□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 ABCC5O15440 1437 aa11.81□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 SAMD9Q5K651 1589 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 HFM1A2PYH4 1435 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 DAPK1P53355 1430 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 UACAQ9BZF9 1416 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.78□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 MAP3K1Q13233 1512 aa11.78□□□□□ -0.52
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF15Q9NS87 1388 aa11.78□□□□□ -0.52
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ACTBP13-201ENST00000423971 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.77□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.76□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.76□□□□□ -0.53
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ACTBP13-201ENST00000423971 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 RAPGEF3O95398 923 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 KDM6BO15054 1643 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF14Q15058 1648 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 MRS2Q9HD23 443 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 NUP160Q12769 1436 aa11.74□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.74□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC184Q52MB2 194 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTBP13-201ENST00000423971 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.71□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 MIA2Q96PC5 1412 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 NCOA1Q15788 1441 aa11.69□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 CHD1O14646 1710 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP13-201ENST00000423971 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 STK26Q9P289 416 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 AKNAQ7Z591 1439 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC24A1O60721 1099 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 PLEKHG5O94827 1062 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 TMC1Q8TDI8 760 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTBP13-201ENST00000423971 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.61□□□□□ -0.55
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