RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402876.3

PARVB-202, Transcript of parvin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PARVB, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVB-202ENST00000402876 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.38■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.38■■■□□ 2.29
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PARVB-202ENST00000402876 PLCH2O75038 1416 aa29.35■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
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PARVB-202ENST00000402876 ITGAEP38570 1179 aa29.31■■■□□ 2.28
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PARVB-202ENST00000402876 GLI2P10070 1586 aa29.29■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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PARVB-202ENST00000402876 DIP2BQ9P265 1576 aa29.26■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.25■■■□□ 2.27
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PARVB-202ENST00000402876 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.24■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.23■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 DAPK1P53355 1430 aa29.23■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 CD109Q6YHK3 1445 aa29.21■■■□□ 2.27
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PARVB-202ENST00000402876 ABCC5O15440 1437 aa29.18■■■□□ 2.26
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PARVB-202ENST00000402876 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.17■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.15■■■□□ 2.26
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PARVB-202ENST00000402876 AKNAQ7Z591 1439 aa29.11■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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PARVB-202ENST00000402876 HFM1A2PYH4 1435 aa29.08■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.08■■■□□ 2.25
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PARVB-202ENST00000402876 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.05■■■□□ 2.24
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PARVB-202ENST00000402876 TSPOAP1O95153 1857 aa29.04■■■□□ 2.24
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PARVB-202ENST00000402876 TSPY10P0CW01 314 aa29.03■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
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PARVB-202ENST00000402876 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.99■■■□□ 2.23
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PARVB-202ENST00000402876 AFAP1Q8N556 730 aa28.84■■■□□ 2.21
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PARVB-202ENST00000402876 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.8■■■□□ 2.2
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PARVB-202ENST00000402876 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.76■■■□□ 2.19
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PARVB-202ENST00000402876 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.72■■■□□ 2.19
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PARVB-202ENST00000402876 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.62■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
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PARVB-202ENST00000402876 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
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PARVB-202ENST00000402876 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.55■■■□□ 2.16
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